Munafri lahir di [[Majene]], [[Sulawesi Selatan]] (kini [[Sulawesi Barat]]) pada tanggal 20 September 1975.<ref name="kpupdf">{{cite web |title=Daftar Riwayat Hidup Calon Walikota Makassar |url=https://infopemilu.kpu.go.id/download/silon/upload-berkas/648/648_Dokumen_13_1_KD_.pdf |publisher=Komisi Pemilihan Umum |accessdate=16 August 2018 |language=id}}</ref> Bapak iparnyamertuanya, [[Aksa Mahmud]], adalah pendiri [[Bosowa Corporation]] dan salah satu orang terkaya di Indonesia sekaligus adik ipar [[Jusuf Kalla]], [[Wakil Presiden Indonesia]] ke-10 dan ke-12. Istri Munafri, Melinda Aksa Mahmud, adalah CEO Bosowa Education; keduanya memiliki empat anak.<ref>{{cite news |title=Golkar Usung Keponakan Jusuf Kalla di Pilkada Makassar |url=https://regional.kompas.com/read/2017/10/28/19240091/golkar-usung-keponakan-jusuf-kalla-di-pilkada-makassar |accessdate=16 August 2018 |work=KOMPAS |date=28 October 2017 |language=id}}</ref><ref>{{cite web |title=#32 Aksa Mahmud |url=https://www.forbes.com/profile/aksa-mahmud/#76d9bcdf3a0b |publisher=Forbes |accessdate=16 August 2018}}</ref><ref>{{cite news |title=Jadi Saksi |url=https://antarafoto.com/peristiwa/v1193389901/jadi-saksi |accessdate=27 August 2018 |work=antarafoto.com |date=26 October 2007}}</ref>
Munafri mengenyam pendidikan dasar sampai tinggi di Makassar. Ia mendapat gelar S1 hukum dari [[Universitas Hasanuddin]] pada tahun 1999.<ref name="kpupdf"/>