Dalam Mobile Suit Gundam SEED Destiny, kemampuannya dalam menggunakan pistol meningkat, dan terlihat pada saat Lacus hendak dibunuh oleh Coordinator suruhan [[Gilbert Durandal]].
== Hubungannya dengan Fllay Allster dan Lacus Clyne ==
Pada awalnya, Kira hanya dimanfaatkan oleh [[Fllay Allster|Flay]] untuk melindungi Archangel dalam pertempuran. Fllay pun melaksanakan niat tersebut dengan cara pura-pura cinta kepada Kira, bahkan Fllay pun pernah [[Sex|berhubungan]] dengan Kira<ref>''MOBILE SUIT Gundam Seed PHASE 16''</ref>(hal ini merupakan yang pertama bagi seorang tokoh utama serial [[Gundam]] melakukan hubungan sex). Namun pada akhirnya, tanpa sebab yang jelas, Kira pun memutuskan hubungan dengan Fllay.
Sementara hubungan Kira dengan Lacus ditandai ketika Lacus memberikan cincin ibunya kepada Kira, yang diikuti dengan ciuman di pipi. Dalam tradisi Jepang, ketika seorang perempuan memberikan sebuah ornamen kepada seorang laki-laki, umumnya hal ini merupakan tanda cinta romantis dan kemudian menjadi pernikahan. Hubungan mereka semakin erat pada saat Lacus memberikan [[ZGMF-X10A Freedom Gundam]] kepada Kira.
