Virus: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
→Klasifikasi: Klasifikasi ICTV |
→Klasifikasi: Klasifikasi Baltimore |
||
Baris 321:
Klasifikasi bertujuan untuk menggambarkan keanekaragaman virus dengan memberi nama dan mengelompokkan virus berdasarkan kesamaan mereka. Pada tahun 1962, André Lwoff, Robert Horne, dan Paul Tournier merupakan orang-orang pertama yang mengembangkan pengelompokan virus berdasarkan sistem hierarki [[taksonomi Linnaeus|Linnaeus]].<ref name="pmid14467544">{{cite journal | vauthors = Lwoff A, Horne RW, Tournier P | title = [A virus system] | language = French | journal = Comptes Rendus Hebdomadaires des Seances de l'Academie des Sciences | volume = 254 | pages = 4225–7 | date = June 1962 | pmid = 14467544 }}</ref> Sistem ini menggunakan klasifikasi [[filum]], [[Kelas (biologi)|kelas]], [[Ordo (biologi)|bangsa]], [[Famili (biologi)|keluarga]], [[genus|marga]], dan [[spesies]]. Virus dikelompokkan sesuai dengan kesamaan sifat mereka (bukan kesamaan inang mereka) dan jenis asam nukleat yang membentuk genom mereka.<ref name="pmid13931895">{{cite journal | vauthors = Lwoff A, Horne R, Tournier P | title = A system of viruses | journal = Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology | volume = 27 | pages = 51–5 | year = 1962 | pmid = 13931895 | doi = 10.1101/sqb.1962.027.001.008 }}</ref> Pada tahun 1966, [[Komite Internasional Taksonomi Virus]] (ICTV) dibentuk. Sistem yang diusulkan oleh Lwoff, Horne, dan Tournier tidak pernah sepenuhnya diterima oleh ICTV karena ukuran genom virus yang kecil dan tingkat mutasi mereka yang tinggi membuat sulit untuk menentukan takson virus di atas ordo (bangsa). Oleh sebab itu, [[klasifikasi Baltimore]] digunakan untuk melengkapi hierarki yang lebih tradisional.<ref name="pmid16105179">{{cite journal | vauthors = Fauquet CM, Fargette D | title = International Committee on Taxonomy of Viruses and the 3,142 unassigned species | journal = Virology Journal | volume = 2 | issue = | pages = 64 | date = August 2005 | pmid = 16105179 | pmc = 1208960 | doi = 10.1186/1743-422X-2-64 }}</ref>
=== Klasifikasi
Komite Internasional Taksonomi Virus (ICTV) mengembangkan sistem klasifikasi yang digunakan saat ini dan menulis pedoman yang memberi bobot lebih besar pada sifat-sifat virus tertentu untuk menjaga keseragaman keluarga virus. Taksonomi terpadu (sistem universal untuk mengklasifikasikan virus) telah ditetapkan. Peneliti baru mendeskripsikan sebagian kecil dari total keragaman virus yang ada di bumi. <ref>{{cite journal | vauthors = Delwart EL | title = Viral metagenomics | journal = Reviews in Medical Virology | volume = 17 | issue = 2 | pages = 115–31 | year = 2007 | pmid = 17295196 | doi = 10.1002/rmv.532 }}</ref>▼
Seperti [[Klasifikasi ilmiah|taksonomi]] makhluk hidup pada umumnya, klasifikasi virus juga dilakukan secara hierarkis atau bertingkat. Sistem klasifikasi virus yang diusulkan oleh ICTV pada tahun 2018 yaitu:<ref>{{cite web|last=ICTV|first=|year=2018a|title=ICTV Code: The International Code of Virus Classification and Nomenclature October 2018|url=https://talk.ictvonline.org/information/w/ictv-information/383/ictv-code|language=en|website=International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)|access-date=16 Agustus 2019}}</ref>▼
:''Realm'' (''-viria'')▼
::''Subrealm'' (''-vira'')▼
:::[[Kerajaan (biologi)|Kerajaan]] (''-viriae'')▼
::::Subkingdom (''-virites'')▼
:::::[[Filum]] (''-viricota'')▼
::::::Subfilum (''-viricotina'')▼
:::::::[[Kelas (biologi)|Kelas]] (''-viricetes'')▼
::::::::Subkelas (''-viricetidae'')▼
:::::::::[[Ordo (biologi)|Ordo]] (''-virales'')▼
::::::::::Subordo (''-virineae'')▼
:::::::::::[[Keluarga (ilmu biologi)|Keluarga]] (''-viridae'')▼
::::::::::::Subkeluarga (''-virinae'')▼
:::::::::::::[[Genus]] (''-virus'')▼
::::::::::::::Subgenus (''-virus'')▼
:::::::::::::::[[Spesies]]▼
Dalam klasifikasi virus, terdapat banyak takson yang dikategorikan sebagai ''[[incertae sedis]]'' atau penempatannya tidak pasti. Pada tahun 2018, virus dikelompokkan dalam 1 ''realm'', 1 filum, 2 subfilum, 6 kelas, 14 ordo, 150 keluarga, 79 subkeluarga, 1.019 genus, 59 subgenus, dan 5.560 spesies.<ref>ICTV Virus Taxonomy [https://talk.ictvonline.org/taxonomy/p/taxonomy_releases ICTV Virus Taxonomy Release History]</ref>▼
Virus dapat diklasifikasi menurut morfologi, tropisme dan cara penyebaran, dan genomik fungsional.<ref name=Carter3>{{citation
|title= Virology: Principles and Application
Baris 390 ⟶ 369:
Virus DNA merupakan virus yang memiliki [[materi genetik]] berupa [[DNA]], kelompok yang tergolong dalam kelompok ini adalah virus kelas I, II, VII. Beberapa contoh [[familia]] virus yang termasuk ke dalam kelompok ini adalah Herpesviridae, Parvoviridae, dan Poxviridae.<ref name="Cheville2">{{citation|title=Ultrastructural Pathology : an Introduction to Interpretion|last1=Cheville|first1=NF.|publisher=Iowa State University Press|location=Iowa|year=1994|isbn=0-8138-2398-6}} ({{google books with page|goT81SrfK1MC|lihat|502|retroviridae}})g
</ref>
=== Klasifikasi ICTV ===
▲Komite Internasional Taksonomi Virus (ICTV) mengembangkan sistem klasifikasi yang digunakan saat ini dan menulis pedoman yang memberi bobot lebih besar pada sifat-sifat virus tertentu untuk menjaga keseragaman keluarga virus. Taksonomi terpadu (sistem universal untuk mengklasifikasikan virus) telah ditetapkan. Peneliti baru mendeskripsikan sebagian kecil dari total keragaman virus yang ada di bumi. <ref>{{cite journal | vauthors = Delwart EL | title = Viral metagenomics | journal = Reviews in Medical Virology | volume = 17 | issue = 2 | pages = 115–31 | year = 2007 | pmid = 17295196 | doi = 10.1002/rmv.532 }}</ref>
▲Seperti [[Klasifikasi ilmiah|taksonomi]] makhluk hidup pada umumnya, klasifikasi virus juga dilakukan secara hierarkis atau bertingkat. Sistem klasifikasi virus yang diusulkan oleh ICTV pada tahun 2018 yaitu:<ref>{{cite web|last=ICTV|first=|year=2018a|title=ICTV Code: The International Code of Virus Classification and Nomenclature October 2018|url=https://talk.ictvonline.org/information/w/ictv-information/383/ictv-code|language=en|website=International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)|access-date=16 Agustus 2019}}</ref>
▲:''Realm'' (''-viria'')
▲::''Subrealm'' (''-vira'')
▲:::[[Kerajaan (biologi)|Kerajaan]] (''-viriae'')
▲::::Subkingdom (''-virites'')
▲:::::[[Filum]] (''-viricota'')
▲::::::Subfilum (''-viricotina'')
▲:::::::[[Kelas (biologi)|Kelas]] (''-viricetes'')
▲::::::::Subkelas (''-viricetidae'')
▲:::::::::[[Ordo (biologi)|Ordo]] (''-virales'')
▲::::::::::Subordo (''-virineae'')
▲:::::::::::[[Keluarga (ilmu biologi)|Keluarga]] (''-viridae'')
▲::::::::::::Subkeluarga (''-virinae'')
▲:::::::::::::[[Genus]] (''-virus'')
▲::::::::::::::Subgenus (''-virus'')
▲:::::::::::::::[[Spesies]]
▲Dalam klasifikasi virus, terdapat banyak takson yang dikategorikan sebagai ''[[incertae sedis]]'' atau penempatannya tidak pasti. Pada tahun 2018, virus dikelompokkan dalam 1 ''realm'', 1 filum, 2 subfilum, 6 kelas, 14 ordo, 150 keluarga, 79 subkeluarga, 1.019 genus, 59 subgenus, dan 5.560 spesies.<ref>ICTV Virus Taxonomy [https://talk.ictvonline.org/taxonomy/p/taxonomy_releases ICTV Virus Taxonomy Release History]</ref>
=== Klasifikasi Baltimore ===
[[Berkas:VirusBaltimoreClassification.svg|jmpl|upright=1.6|Klasifikasi Baltimore yang mengelompokkan virus berdasarkan metode sintesis mRNA mereka.]]
{{main|Klasifikasi Baltimore}}
Ahli biologi dan pemenang Hadiah Nobel [[David Baltimore]] merancang sistem [[klasifikasi Baltimore]].<ref name="pmid4348509" /><ref name="pmid4377923">{{cite journal | vauthors = Baltimore D | title = The strategy of RNA viruses | journal = Harvey Lectures | volume = 70 Series | pages = 57–74 | year = 1974 | pmid = 4377923 }}</ref> Dalam klasifikasi virus modern, sistem klasifikasi ICTV digunakan bersama dengan sistem klasifikasi Baltimore.<ref name="pmid15078590">{{cite journal | vauthors = van Regenmortel MH, Mahy BW | title = Emerging issues in virus taxonomy | journal = Emerging Infectious Diseases | volume = 10 | issue = 1 | pages = 8–13 | date = January 2004 | pmid = 15078590 | pmc = 3322749 | doi = 10.3201/eid1001.030279 }}</ref><ref name="pmid10486120">{{cite journal | vauthors = Mayo MA | title = Developments in plant virus taxonomy since the publication of the 6th ICTV Report. International Committee on Taxonomy of Viruses | journal = Archives of Virology | volume = 144 | issue = 8 | pages = 1659–66 | year = 1999 | pmid = 10486120 | doi = 10.1007/s007050050620 }}</ref><ref name="pmid15183049">{{cite journal | vauthors = de Villiers EM, Fauquet C, Broker TR, Bernard HU, zur Hausen H | title = Classification of papillomaviruses | journal = Virology | volume = 324 | issue = 1 | pages = 17–27 | date = June 2004 | pmid = 15183049 | doi = 10.1016/j.virol.2004.03.033 }}</ref>
Klasifikasi virus Baltimore didasarkan pada mekanisme sintesis [[mRNA]]. Virus harus menghasilkan mRNA dari genomnya untuk menghasilkan protein dan mereplikasi diri mereka sendiri, tetapi mekanisme yang digunakan oleh virus untuk mencapai hal ini berbeda-beda. Genom virus mungkin beruntai tunggal (''single-stranded'', disingkat ss) atau beruntai ganda (''double-stranded'', disingkat ds), baik berupa RNA atau DNA, dan mungkin menggunakan atau tidak menggunakan [[transkriptase balik]] (''reverse transcriptase'', disingkat RT). Selain itu, virus RNA untai tunggal dapat bersifat positif (+) atau negatif (-). Klasifikasi ini menempatkan virus ke dalam tujuh kelompok:
* Virus dsDNA
* Virus ssDNA
* Virus dsRNA
* Virus ssRNA(+)
* Virus ssRNA(-)
* Virus ssRNA-RT
* Virus dsDNA-RT
Sebagai contoh penerapan klasifikasi virus, virus penyebab [[cacar air]], yaitu [[virus varicella-zoster]] (VZV), ditempatkan dalam ordo ''[[Herpesvirales]]'', keluarga ''[[Herpesviridae]]'', subkeluarga ''[[Alphaherpesvirinae]]'', dan genus ''[[Varicellovirus]]''. VZV berada di Grup I dari Klasifikasi Baltimore karena merupakan virus dsDNA yang tidak menggunakan enzim transkriptase balik.
== Virus dan penyakit ==
| |||