Sepanjang karirnyakariernya, Yudian telah menulis segudang artikel ilmiah yang bertemakan Islam kontemporer. Beberapa di antaranya adalah ''Aliran dan Teori Filsafat Islam'' (1995), ''Hassan Hanafion Salafism and Secularism'' (2006), dan ''Berfilsafat Hukum Islam dari Harvard ke Sunan Kalijaga'' (2014). Yudian juga termasuk produktif sebagai penulis dan penerjemah. Ia telah menerjemahkan 40 buku bahasa Arab, 13 bahasa Inggris, dan dua buku berbahasa Prancis ke bahasa Indonesia. Pada 2016, ia turut mendirikan TK, SD dan SMP Sunan Averroes Islamic Boarding School.<ref name=kata/>
