Pseudogen: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
Tidak ada ringkasan suntingan Tag: Suntingan visualeditor-wikitext |
Tidak ada ringkasan suntingan Tag: Suntingan visualeditor-wikitext |
||
Baris 28:
Akibatnya, gen yang telah bermutasi secara bertahap menjadi pseudogen dan akan menjadi tidak terekspresikan atau tidak berfungsi. Nasib evolusioner semacam ini ditunjukkan oleh populasi [[model genetik]]<ref name="pmid7705642">{{cite journal |vauthors= Walsh JB |title= How often do duplicated genes evolve new functions? |journal= Genetics |volume= 139 |issue= 1 |pages= 421–8 |date= January 1995 |pmid= 7705642 |pmc= 1206338 |doi=}}</ref><ref name="pmid11779815">{{cite journal |vauthors= Lynch M, O'Hely M, Walsh B, Force A |title= The probability of preservation of a newly arisen gene duplicate |journal= Genetics |volume= 159 |issue= 4 |pages= 1789–804 |date= December 2001 |pmid= 11779815 |pmc= 1461922 |doi=}}</ref> dan juga oleh [[analisis genom]].<ref name="Lynch_Conery_2000"/><ref name="Harrison_2002">{{cite journal |vauthors= Harrison PM, Hegyi H, Balasubramanian S, Luscombe NM, Bertone P, Echols N, Johnson T, Gerstein M |title= Molecular fossils in the human genome: identification and analysis of the pseudogenes in chromosomes 21 and 22 |journal= Genome Research |volume= 12 |issue= 2 |pages= 272–80 |date= February 2002 |pmid= 11827946 |pmc= 155275 |doi= 10.1101/gr.207102}}</ref> Menurut konteks evolusi, pseudogen ini akan dihapus atau menjadi sangat berbeda dari gen induk sehingga tidak dapat diidentifikasi lagi. Pseudogen yang relatif muda dapat dikenali karena kemiripan urutannya.<ref name="Zhang_2003">{{cite journal |vauthors= Zhang J |title= Evolution by gene duplication: an update. |journal= Trends in Ecology and Evolution |year= 2003 |volume= 18 |issue= 6 |pages= 292–298 |doi= 10.1016/S0169-5347(03)00033-8}}</ref>
===Pseudogen kesatuan===
[[File:Pseudogene4jpg.jpg|thumb|2 cara pseudogen diproduksi]]
Berbagai mutasi (seperti [[indel]] dan [[mutasi nonsense]]) dapat mencegah gen menjadi normal [[transkripsi (biologi) | ditranskripsikan]] atau [[Terjemahan (biologi) | diterjemahkan]], dan sehingga gen tersebut menjadi kurang- atau tidak berfungsi atau "dinonaktifkan". Ini adalah mekanisme yang sama dimana gen yang tidak diproses menjadi pseudogen, tetapi perbedaan dalam kasus ini adalah bahwa gen tidak diduplikasi sebelum pseudogenisasi. Biasanya, pseudogen seperti itu tidak mungkin menjadi tetap dalam suatu populasi, tetapi berbagai efek populasi, seperti [[pergeseran genetik]], [[hambatan populasi]], atau, dalam beberapa kasus, [[seleksi alam]], dapat menyebabkan fiksasi. Contoh klasik dari pseudogen kesatuan adalah gen yang diduga mengkodekan enzim [[L-gulonolactone oxidase | L-gulono-γ-lactone oxidase]] (GULO) pada primata. Pada semua mamalia yang dipelajari selain primata (kecuali marmut), GULO membantu biosintesis [[asam askorbat]] (vitamin C), tetapi ia ada sebagai gen yang cacat (GULOP) pada manusia dan primata lainnya.<ref name="Nishikimi _1992">{{cite journal |vauthors= Nishikimi M, Kawai T, Yagi K |title= Guinea pigs possess a highly mutated gene for L-gulono-gamma-lactone oxidase, the key enzyme for L-ascorbic acid biosynthesis missing in this species |journal= The Journal of Biological Chemistry |volume= 267 |issue= 30 |pages= 21967–72 |date= October 1992 |pmid= 1400507}}</ref><ref name="Nishikimi _1994">{{cite journal |vauthors= Nishikimi M, Fukuyama R, Minoshima S, Shimizu N, Yagi K |title= Cloning and chromosomal mapping of the human nonfunctional gene for L-gulono-gamma-lactone oxidase, the enzyme for L-ascorbic acid biosynthesis missing in man |journal= The Journal of Biological Chemistry |volume= 269 |issue= 18 |pages= 13685–8 |date= May 1994 |pmid= 8175804}}</ref>
Contoh lain yang lebih baru dari gen yang cacat menghubungkan deaktivasi gen [[caspase 12]] (melalui [[mutasi nonsense]]) ke seleksi positif pada manusia.<ref name="Xue_2006">{{cite journal |vauthors= Xue Y, Daly A, Yngvadottir B, Liu M, Coop G, Kim Y, Sabeti P, Chen Y, Stalker J, Huckle E, Burton J, Leonard S, Rogers J, Tyler-Smith C |title= Spread of an inactive form of caspase-12 in humans is due to recent positive selection |journal= American Journal of Human Genetics |volume= 78 |issue= 4 |pages= 659–70 |date= April 2006 |pmid= 16532395 |pmc= 1424700 |doi= 10.1086/503116}}</ref> Telah dibuktikan bahwa pseudogen yang diproses mengakumulasi mutasi lebih cepat daripada pseudogen yang tidak diproses.<ref name="Zheng">{{cite journal |vauthors= Zheng D, Frankish A, Baertsch R, Kapranov P, Reymond A, Choo SW, Lu Y, Denoeud F, Antonarakis SE, Snyder M, Ruan Y, Wei CL, Gingeras TR, Guigó R, Harrow J, Gerstein MB |title= Pseudogenes in the ENCODE regions: consensus annotation, analysis of transcription, and evolution |journal= Genome Research |volume= 17 |issue= 6 |pages= 839–51 |date= June 2007 |pmid= 17568002 |pmc= 1891343 |doi= 10.1101/gr.5586307}}</ref>
== Referensi ==
{{
==Bacaan selanjutnya==
{{Refbegin|35em}}
*{{cite journal |vauthors= Gerstein M, Zheng D |title= The real life of pseudogenes |journal= Scientific American |volume= 295 |issue= 2 |pages= 48–55 |date= August 2006 |pmid= 16866288 |doi= 10.1038/scientificamerican0806-48|bibcode= 2006SciAm.295b..48G }}
*{{cite journal |vauthors= Torrents D, Suyama M, Zdobnov E, Bork P |title= A genome-wide survey of human pseudogenes |journal= Genome Research |volume= 13 |issue= 12 |pages= 2559–67 |date= December 2003 |pmid= 14656963 |pmc= 403797 |doi= 10.1101/gr.1455503}}
*{{cite journal |vauthors= Bischof JM, Chiang AP, Scheetz TE, Stone EM, Casavant TL, Sheffield VC, Braun TA |title= Genome-wide identification of pseudogenes capable of disease-causing gene conversion |journal= Human Mutation |volume= 27 |issue= 6 |pages= 545–52 |date= June 2006 |pmid= 16671097 |doi= 10.1002/humu.20335}}
{{Refend}}
==Pranala luar==
*[https://web.archive.org/web/20110222111721/http://starbase.sysu.edu.cn/ Pseudogene interaction database, miRNA-pseudogene and protein-pseudogene interaction maps database]
*[https://web.archive.org/web/20150211035244/http://www.pseudogene.org/ Yale University pseudogene database]
*[https://web.archive.org/web/20140717062856/http://pbil.univ-lyon1.fr/databases/hoppsigen.html Hoppsigen database] (homologous processed pseudogenes)
*[https://www.bioinfo.mochsl.org.br/rcpedia/ RCPedia - Processed Pseudogene database]
[[Kategori:Biologi]]
| |||