Biokimia: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
RianHS (bicara | kontrib)
RianHS (bicara | kontrib)
→‎Protein: Merapikan, adopsi dari en:Biochemistry
Baris 78:
Struktur protein bisa dijelaskan melalui empat tingkatan. [[Struktur protein|Struktur primer]] protein terdiri dari rangkaian linier asam amino, misalnya, "alanin-glisin-triptofan-serin-glutamat-asparagin-glisin-lisin-…". [[Struktur protein|Struktur sekunder]] lebih berkaitan dengan morfologi lokal (morfologi adalah studi tentang struktur). Beberapa kombinasi asam amino akan cenderung membentuk gulungan yang disebut dengan [[Pilinan alfa|pilinan alfa (''α-helix'')]] atau menjadi lembaran yang disebut dengan [[Lembaran beta|lembaran beta (''β-sheet'')]]. [[Struktur protein|Struktur tersier]] merupakan bentuk tiga dimensi protein secara keseluruhan. Bentuk ini ditentukan oleh urutan asam amino. Jika ada satu perubahan saja, keseluruhan struktur dapat berubah. Sebagai contoh, rantai alfa pada [[hemoglobin]] terdiri dari 146 residu asam amino; jika residu [[glutamat]] di posisi ke-6 digantikan dengan [[valin]], sifat hemoglobin akan berubah dan mengakibatkan penyakit [[anemia sel sabit]]. Terakhir, [[Struktur protein|struktur kuartener]] berkaitan dengan struktur protein dengan beberapa subunit peptida, misalnya hemoglobin dengan keempat subunitnya. Tidak semua protein memiliki lebih dari satu subunit.<ref>[[Biochemistry#Fromm|Fromm and Hargrove]] (2012), pp. 35–51.</ref>
[[Berkas:Protein_structure_examples.png|pra=https://wiki-indonesia.club/wiki/Berkas:Protein_structure_examples.png|pus|jmpl|987x987px|Contoh struktur protein dari [[Protein Data Bank]]]]
Protein yang masuk ke dalam tubuh akan dipecah menjadi asam amino atau dipeptida di dalam [[usus halus]], baru kemudian bisa diserap oleh tubuh. Nantinya, asam amino ini dapat bergabung kembali untuk membentuk protein yang baru. Produk antara dari [[glikolisis]], [[siklus asam sitrat]], dan [[jalur fosfat pentosa]] dapat digunakan untuk membentuk kedua puluh macam asam amino. Sebagian besar bakteri dan tumbuhan memiliki semua enzim yang diperlukan untuk menyintesisnya. Manusia dan mamalia lainnya hanya dapat mensintesamenyintesis separuhsebagian dari ke-20 macam amino tersebut. Tubuh manusiamereka tidak dapat mensintesamenyintesis [[isoleusin]], [[leusin]], [[lisin]], [[metionin]], [[fenilalanin]], [[treonin]], [[triptofan]], dan [[valin]]. AsamKarena harus didapatkan dari luar tubuh, asam amino jenis ini merupakan [[asam amino esensial]],. karenaMamalia pentingmemiliki bagienzim tubuh.untuk Mamalia dapat mensintesamenyintesis asam amino non esensialnonesensial, yaitu [[alanin]], [[asparagin]], [[aspartat]], [[sistein]], [[glutamat]], [[glutamin]], [[glisin]], [[prolin]], [[serin]], dan [[tirosin]]. [[Arginin]] dan [[histidin]] juga dapat disintesadisintesis oleh mamalia, tetapi hanya dapat diproduksi dalam jumlah terbatas, sehingga terkadang juga disebut sebagai asam amino esensial.
 
Jika gugus amino dilepaskan dari sebuah asam amino, maka akan menyisakan kerangka karbon yang disebut [[asam keto]]-α. Enzim [[transaminase]] akandapat dengan mudah memindahkan gugus amino yangdari lepassatu iniasam amino (menjadikannya sebuah asam keto-α) ke asam keto-α lainnya (menjadikannya sebuah asam amino). Hal ini penting di dalam biosintesis dari asam amino, seperti dalam banyak jalur, zat antara dari jalur[[Lintasan metabolisme|lintasan biokimia]] lainnya akan diubah menjadi kerangka asam keto-α, lalu sebuah gugus amino ditambahkan lewat [[transaminasi]]. Maka, asam amino dapat digabung-gabungkan untuk membentuk protein.
 
Proses yang mirip digunakan untuk memecah protein. Pertama-tama, protein akan terhidrolisadihidrolisis menjadi komponen-komponennya, yaitu asam amino. [[Amonia]] bebas (NH<sub>3</sub>), beradayang ada dalam bentuk ion [[amonium]] (NH<sub>4</sub><sup>+</sup>) di dalam darah, akan berbahaya bagi tubuh, makasehingga harus dikeluarkan. Organisme [[uniseluler]] hanya tinggal melepaskan saja amonia ini keluar tubuh. DiDemikian pula [[Osteichthyes|ikan bertulang sejati]] yang dapat melepaskan amonia ke dalam tubuhair mamaliayang diencerkan dengan cepat. Secara umum, amoniamamalia akanmengubah diubahamonia menjadi urea, lewat [[siklus urea]].
 
Untuk menentukan apakah dua protein saling terkait, atau dengan kata lain untuk memutuskan apakah mereka homolog atau tidak, para ilmuwan menggunakan metode perbandingan urutan. Metode seperti [[penjajaran urutan]] dan [[penjajaran struktural]] merupakan cara ampuh yang membantu ilmuwan mengidentifikasi [[Homologi urutan|homologi]] di antara molekul terkait. Selain untuk mengetahui pola evolusi [[Famili protein|keluarga protein]], penemuan homologi protein juga untuk mengetahui kemiripan dua protein beserta struktur dan fungsinya.
 
=== Asam nukleat ===