Hasil kesepakatan tersebut, mendapatkan respon positif dan dukungan penuh dari pihak Kopertais wilayah IV Surabaya. Tepatnya, tanggal 24 Oktober 2004 mendapatkan SK Ijin Operasional dari Dirjen Bagais Departemen Agama RI No. Dj.II/27/2004. Tahun itu juga, STAI Al-Hamidiyah Bangkalan diresmikan dan dihadiri oleh Bapak Said Agil Husin Al-Munawwar dengan program studi Pendidikan Agama Islam (PAI). SK tersebut diperpanjang melalui SK Dirjen Pendidikan Islam No. DJ.I/385/2008 tanggal 27 Oktober 2008.
== Visi ==
Terwujudnya Perguruan Tinggi Islam yang Mencetak Sarjana Pendidikan Islam yang Unggul dan Kompetitif dengan Dasar Perpaduan Harmonis Komitmen Ke-Imanan, Ke-Islaman, dan Ke-Indonesiaan.
== Misi ==
# Mencerdaskan kehidupan bangsa melalui pendidikan formal dalam rangka mencetak manusia paripurna yang beriman dan bertaqwa kepada Tuhan Yang Maha Esa.
# Menggalang partisipasi kritis, Konstruksi dari masyarakat dan pemerintah untuk lebih memahami proses pembangunan di masa lampau, sekarang dan masa akan datang.
# Membentuk jaringan yang Komunikatif dan interaktif antara masyarakat dan pemerintah guna memupuk kesatuan persepsi, menerima tanggung jawab dan tugas generasi masa depan yang tangguh dan handal sesuai dengan tujuan pendidikan nasional.
== Tujuan ==
# Meningkatnya mutu pengelolaan kelembagaan dan sistem pendidikan yang berkualitas, profesional, transparan, dan akuntabel.
# Terselengaranya penelitian dan pengabdian pada masyarakat yang unggul di keislaman.
# Terjalinnya kerjasama dengan stakeholder di keislaman.
