Revisi per 2 Maret 2021 16.00 sunting S Rifqi (bicara \| kontrib) 1.418 suntingan kTidak ada ringkasan suntingan Tag: Dikembalikan ← Revisi sebelumnya		Revisi per 19 Maret 2021 04.00 sunting balikkan S Rifqi (bicara \| kontrib) 1.418 suntingan pengembangan artikel; N439K Tag: Dikembalikan Revisi selanjutnya →
Baris 16: === Cluster 5 === {{utama\|Cluster 5}} [[Cluster 5]], juga disebut sebagai ΔFVI-spike oleh [[State Serum Institute]] (SSI) Denmark, ditemukan di [[Jutlandia]] Utara, [[Denmark]], dan diyakini telah menyebar dari [[~~cerpelai~~mink]] ke manusia melalui [[peternakan bulu]]. Pada 4 November 2020, diumumkan bahwa populasi cerpelai di Denmark akan dimusnahkan untuk mencegah kemungkinan penyebaran mutasi ini dan mengurangi risiko terjadinya mutasi baru. Karantina wilayah dan pembatasan perjalanan diberlakukan di tujuh kota di Jutlandia Utara untuk mencegah penyebaran mutasi yang dapat membahayakan tanggapan [[Pandemi COVID-19 di Denmark\|nasional]] atau internasional terhadap [[pandemi COVID-19]].<ref>{{cite web \|url=https://www.sum.dk/Aktuelt/Nyheder/Coronavirus/2020/November/De-fleste-restriktioner-lempes-i-Nordjylland.aspx \|title=De fleste restriktioner læmpes i Nordjylland \|date=19 November 2020 \|publisher=Sundheds- og Ældreministeriet \|trans-title=Kebanyakan Pembatasan Sosial di Jutlandia Utara Dilonggarkan}}</ref> === Garis keturunan B.1.1.7 === {{utama\|Garis keturunan B.1.1.7}} [[Garis keturunan B.1.1.7]]<ref>{{cite report \|author1=Rambaut, Andrew \|author2=Loman, Nick \|author3=Pybus, Oliver \|author4=Barclay, Wendy \|author5=Barrett, Jeff \|author6=Carabelli, Alesandro \|author7=Connor, Tom \|author8=Peacock, Tom \|author9=L. Robertson, David \|author10=Vol, Erik \|year=2020 \|title=Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations \|publisher=Written on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK \|url=https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563 \|access-date=20 Desember 2020}}</ref>, disebut juga 20I/501Y.V1 atau Variant of Concern 202012/01 (VOC-202012/01),<ref name="Chand2020">{{cite report \|last1=Chand \|first1=Meera \|last2=Hopkins \|first2=Susan \|last3=Dabrera \|first3=Gavin \|last4=Achison \|first4=Christina \|last5=Barclay \|first5=Wendy \|last6=Ferguson \|first6=Neil \|last7=Volz \|first7=Erik \|last8=Loman \|first8=Nick \|last9=Rambaut \|first9=Andrew \|last10=Barrett \|first10=Jeff \|date=21 Desember 2020 \|title=Investigation of novel SARS-COV-2 variant: Variant of Concern 202012/01 \|publisher=[[Public Health England]] \|url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/947048/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf \|access-date=23 Desember 2020}}</ref> sebelumnya dikenal sebagai Variant Under Investigation pertama pada Desember 2020 (VUI-202012/01), pertama kali terdeteksi pada Oktober 2020 selama [[~~Pandemi~~pandemi COVID-19 di Britania ~~Raya\|pandemi COVID-19 di Inggris~~ Raya]] dari sampel yang diambil bulan sebelumnya.<ref name="CDC">{{cite web \|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html \|author=CDC \|title=Emerging SARS-CoV-2 Variants \|publisher=Centers for Disease Control and Prevention \|language=en-us \|access-date=4 Januari 2021}} {{PD-notice}}</ref> Sejak itu, prevalensinya menjadi dua kali lipat setiap 6,5 hari, perkiraan interval generasinya.<ref>{{cite web \|url=https://khub.net/documents/135939561/338928724/New+SARS-COV-2+variant+-+information+and+risk+assessment.pdf/b56d4591-0466-1a18-28dc-010e0fdeef53?t=1608569319930 \|title=New evidence on VUI-202012/01 and review of the public health risk assessment \|date=15 Desember 2020 \|website=khub.net}}</ref><ref>{{cite web \|url=https://www.youtube.com/watch?v=G3CT9N89L-c&t=9399 \|title=COG-UK Showcase Event - YouTube \|publisher=YouTube \|access-date=25 Desember 2020}}</ref> Varian ini berkorelasi dengan peningkatan yang signifikan pada tingkat infeksi COVID-19 di ~~Inggris~~Britania Raya. Peningkatan ini diperkirakan setidaknya sebagian karena mutasi [[#N501Y\|N501Y]]. Pada tanggal 2 Maret 2021, [[Pandemi COVID-19 di Indonesia\|Indonesia]] melaporkan kasus pertamanya untuk varian ini.<ref>{{cite news \|title=Dua Kasus Mutasi Corona Asal Inggris Ditemukan di Indonesia \|date=2 Maret 2021 \|work=CNN Indonesia \|url=https://www.cnnindonesia.com/nasional/20210302120516-20-612595/dua-kasus-mutasi-corona-asal-inggris-ditemukan-di-indonesia \|access-date=2 Maret 2021}}</ref><ref>{{cite news \|title=Wamenkes Laporkan 2 Kasus Pertama Mutasi Corona B117 di Indonesia \|date=2 Maret 2021 \|work=detikHealth \|url=https://health.detik.com/berita-detikhealth/d-5477409/wamenkes-laporkan-2-kasus-pertama-mutasi-corona-b117-di-indonesia \|access-date=2 Maret 2021}}</ref><ref>{{cite news \|author=Jawahir Gustav Rizal \|editor=Sari Hardiyanto \|date=2 Maret 2021 \|title=Mutasi Virus Corona B.1.1.7 Sudah Masuk Indonesia \|work=Kompas.com \|url=https://www.kompas.com/tren/read/2021/03/02/131116365/mutasi-virus-corona-b117-sudah-masuk-indonesia-ini-informasi-lengkapnya?page=all \|access-date=2 Maret 2021}}</ref> === Garis keturunan B.1.351 === Baris 28: == Mutasi penting == {{kembangkan bagian\|date=Maret 2021}} <!-- Daftar mutasi diurutkan berdasarkan posisi asam aminonya. --> === N439K === Mutasi N439K berarti perubahan dari [[asparagina]] (N) menjadi [[lisina]] (K) pada posisi [[asam amino]] 439.<ref>{{cite journal \|last1=Mercatelli \|first1=Daniele \|last2=Triboli \|first2=Luca \|last3=Fornasari \|first3=Eleonora \|last4=Ray \|first4=Forest \|last5=Giorgi \|first5=Federico M. \|date=18 November 2020 \|title=Coronapp: A web application to annotate and monitor SARS‐CoV‐2 mutations \|journal=Journal of Medical Virology \|doi=10.1002/jmv.26678 \|doi-access=free \|language=en \|url=https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jmv.26678}}</ref><ref>{{cite journal \|last1=Zhou \|first1=Wenyang \|last2=Xu \|first2=Chang \|last3=Wang \|first3=Pingping \|last4=Luo \|first4=Meng \|last5=Xu \|first5=Zhaochun \|last6=Cheng \|first6=Rui \|last7=Jin \|first7=Xiyun \|last8=Guo \|first8=Yu \|last9=Xue \|first9=Guangfu \|last10=Juan \|first10=Liran \|last11=Nie \|first11=Huan \|last12=Jiang \|first12=Qinghua \|date=23 November 2020 \|title=N439K variant in spike protein may alter the infection efficiency and antigenicity of SARS-CoV-2 based on molecular dynamics simulation \|publisher=bioRxiv \|doi=10.1101/2020.11.21.392407 \|language=en}}</ref> Mutasi ini diyakini pertama kali ditemukan pada musim semi tahun 2020 di [[Skotlandia]].<ref>{{cite web \|url=http://www.theguardian.com/world/2020/oct/20/scientists-on-lookout-for-covid-mutations-which-cause-treatments-to-lose-potency \|title=Hunt on for future Covid mutations that cause treatments to lose potency \|date=20 Oktober 2020 \|work=[[The Guardian]] \|language=en \|access-date=23 Desember 2020}}</ref> Mutasi ini menghilang selama [[pembatasan sosial]] di negara tersebut. Namun, mutasi ini ditemukan pula di [[Rumania]], [[Norwegia]], [[Swiss]], [[Republik Irlandia\|Irlandia]], [[Belgia]], [[Jerman]], dan [[Britania Raya]].<ref>{{cite web \|url=https://www.theguardian.com/world/2020/oct/20/scientists-on-lookout-for-covid-mutations-which-cause-treatments-to-lose-potency \|editor=Ian Sample \|date=20 Oktober 2020 \|title=Hunt on for future Covid mutations that cause treatments to lose potency \|work=[[The Guardian]] \|issn=0261-3077 \|language=en \|access-date=23 Desember 2020}}</ref> Mutasi ini telah masuk ke [[Indonesia]] sejak bulan November 2020.<ref>{{cite web \|url=https://www.cnnindonesia.com/nasional/20210312132553-20-616673/eijkman-ungkap-48-kasus-mutasi-n439k-terdeteksi-di-indonesia \|title=Eijkman Ungkap 48 Kasus Mutasi N439K Terdeteksi di Indonesia \|date=12 Maret 2021 \|work=[[CNN Indonesia]] \|access-date=19 Maret 2021}}</ref><ref>{{cite web \|url=https://tirto.id/48-kasus-varian-baru-covid-19-n439k-ditemukan-di-indonesia-ga8w \|author=Vincent Fabian Thomas \|date=13 Maret 2021 \|title=48 Kasus Varian Baru COVID-19 N439K Ditemukan di Indonesia \|work=[[Tirto\|Tirto.id]] \|access-date=19 Maret 2021}}</ref> === E484K === Mutasi E484K berarti perubahan dari [[asam glutamat]] (E) menjadi [[lisina]] (K) pada posisi [[asam amino]] 484.<ref>{{cite web \|url=https://www.news-medical.net/health/What-Mutations-of-SARS-CoV-2-are-Causing-Concern.aspx \|last=Greenwood \|first=Michael \|date=15 Januari 2021 \|title="What Mutations of SARS-CoV-2 are Causing Concern?" \|website=News Medical Lifesciences \|access-date=16 Januari 2021}}</ref> Mutasi ini dilaporkan termasuk mutasi kabur, yaitu mutasi yang memudahkan virus untuk kabur dari [[Sistem imun\|sistem kekebalan tubuh]] inangnya,<ref>{{cite web \|url=https://i-base.info/escape-mutation/ \|title=escape mutation \|date=11 Oktober 2012 \|publisher=[[HIV i-Base]] \|access-date=19 Februari 2021}}</ref><ref>{{cite journal \|last=Wise \|first=Jacqui \|date=5 Februari 2021 \|title=Covid-19: The E484K mutation and the risks it poses \|journal=[[The BMJ]] \|volume=372 \|page=n359 \|issn=1756-1833 \|s2cid=231821685 \|doi=10.1136/bmj.n359 \|doi-access=free \|url=https://www.bmj.com/content/372/bmj.n359}}</ref> dari setidaknya satu bentuk [[antibodi monoklonal]] terhadap SARS-CoV-2.<ref name="NIIDJan2021">{{cite press release \|author=<!--(tidak ada)--> \|date=12 Januari 2021 \|title=Brief report: New Variant Strain of SARS-CoV-2 Identified in Travelers from Brazil \|location=Jepang \|publisher=NIID (National Institute of Infectious Diseases) \|url=https://www.niid.go.jp/niid/images/epi/corona/covid19-33-en-210112.pdf \|access-date=14 Januari 2021}}</ref> Mutasi E484K ada dalam varian garis keturunan P.1 ([[Jepang]] dan [[Manaus]]),<ref name="virological2021">{{cite web \|url=https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586 \|title=Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings \|date=12 Januari 2021 \|website=Virological \|language=en \|access-date=23 Januari 2021}}</ref> garis keturunan P.2 ([[Brazil]], juga dikenal dengan B.1.1.248),<ref>{{cite journal \|last1=Voloch \|first1=Carolina M. \|last2=F \|first2=Ronaldo da Silva \|last3=Almeida \|first3=Luiz G. P. de \|last4=Cardoso \|first4=Cynthia C. \|last5=Brustolini \|first5=Otavio J. \|last6=Gerber \|first6=Alexandra L. \|last7=Guimarães \|first7=Ana Paula de C. \|last8=Mariani \|first8=Diana \|last9=Costa \|first9=Raissa Mirella da \|last10=Ferreira \|first10=Orlando C. \|last11=Workgroup \|first11=Covid19-UFRJ \|date=26 Desember 2020 \|title=Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil \|journal=Le Phare de l'Esperanto \|via=MedRxiv \|language=en \|issn=2024-8598 \|s2cid=229379623 \|doi=10.1101/2020.12.23.20248598 \|url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.23.20248598v1}}</ref> dan varian 501.V2 ([[Afrika Selatan]]).<ref name="NIIDJan2021" /> === N501Y === Mutasi N501Y berarti perubahan dari [[asparagina]] (N) menjadi [[tirosina]] (Y) pada posisi [[asam amino]] 501.<ref>{{cite report \|title=COG-UK update on SARS-CoV-2 Spike mutations of special interest: Report 1 \|date=20 December 2020 \|publisher=COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK) \|page=7 \|url=https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2-Mutations_final_updated2.pdf \|access-date=31 Desember 2020 \|archive-url=https://web.archive.org/web/20201225050316/https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2-Mutations_final_updated2.pdf \|archive-date=25 Desember 2020 \|url-status=dead}}</ref> Mutasi ini diyakini dapat meningkatkan kemampuan virus untuk mengikat sel manusia.<ref name="Chand2020" /> Mutasi N501Y ada dalam varian P.1 ([[Jepang]] dan [[Brazil]]),<ref name="NIIDJan2021" /><ref name="virological2021" /> Variant of Concern 202012/01 ([[Britania Raya]]), 501.V2 ([[Afrika Selatan]]), dan COH.20G/501Y ([[Columbus, Ohio]]). == Referensi ==

Varian SARS-CoV-2: Perbedaan antara revisi