'''Liga Nusantara 2016''' adalah edisi kedua dari [[Liga Nusantara]] setelah [[Divisi Dua Liga Indonesia|Divisi II]] dan [[Divisi Tiga Liga Indonesia|Divisi III]] digabung pada musim 2014. Musim 2016 ini untuk babak kualifikasi dikelola oleh komite kompetisi dari Asosiasi Provinsi sedangkan untuk 32 besar putaran nasional kelola oleh PT. Gelora Trisula Semesta.<ref name="ln16a">{{Cite web|url=http://www.fourfourtwo.com/id/features/semua-hal-yang-perlu-kamu-ketahui-tentang-liga-nusantara|title=Semua Hal yang Perlu Kamu Ketahui Tentang Liga Nusantara|date=11 July 2016|website=FouFourTwo|access-date=9 August 2016|archive-date=2016-08-12|archive-url=https://web.archive.org/web/20160812110240/http://www.fourfourtwo.com/id/features/semua-hal-yang-perlu-kamu-ketahui-tentang-liga-nusantara|dead-url=yes}}</ref> kompetisi dimulai pada Mei 2016.
