Prestasi yang cukup gemilang di Tim Nasional Indonesia pada Piala Asia 2007 dan AFC Cup 2008 (bersama PSMS Medan) membuat dia terpilih menjadi nominator PEMAINpemain TERBAIKterbaik ASIAAsia Tahuntahun 2008. Markus dianggap sebagai penjaga gawang yang mampu memimpin lini pertahanan dan baik dalam duel umpan silang. Markus merupakan orang Indonesia pertama sepanjang sejarah yang terpilih sebagai salah satu dari nominasi AFC untuk pemain terbaik Asia tahun 2009.<ref>{{Cite web |url=http://thejakartaglobe.com/football/markus-is-1st-indonesian-up-for-afc-player-of-year/334630 |title=Markus Is 1st Indonesian Up for AFC Player of Year |access-date=2010-05-22 |archive-date=2010-05-01 |archive-url=https://web.archive.org/web/20100501082926/http://www.thejakartaglobe.com/football/markus-is-1st-indonesian-up-for-afc-player-of-year/334630 |dead-url=yes }}</ref> Ia juga terpilih sebagai salah satu nominasi pemain dari [[Perang Bintang 2010]], sebuah ajang sepak bola persahabatan yang mengumpulkan pemain-pemain sepak bola terbaik dari [[Liga Super Indonesia]].<ref>{{cite web|url=http://www.liga-indonesia.co.id/images/content/2010/05/12/9/1391_Nominasi%20Pemain%20Perang%20Bintang%202010.pdf|title=Nominasi Pemain Perang Bintang 2010|author=PT Liga Indonesia|access-date=2010-05-22|archive-date=2010-06-01|archive-url=https://web.archive.org/web/20100601094107/http://www.liga-indonesia.co.id/images/content/2010/05/12/9/1391_Nominasi%20Pemain%20Perang%20Bintang%202010.pdf|dead-url=yes}}</ref>
