Mikrobiota tanah dapat menekan penyakit dan simbion akar yang menguntungkan (jamur mikoriza lebih mudah tumbuh di tanah yang steril). Inokulasi dengan bakteri tanah dapat meningkatkan ekstensi ruas, hasilmemicu dan mempercepat pembungaan. Migrasi bakteri di sepanjang akar bervariasi sesuai dengan kondisi tanah alami tanah. Sebagai contoh, penelitian telah menemukan bahwa sistem perakaran biji [[gandum]] yang diinokulasi dengan Azotobacter menunjukkan populasi yang lebih tinggi di tanah yang mendukung pertumbuhan Azotobacter. Beberapa penelitian tidak berhasil meningkatkan kadar mikroba tertentu (seperti ''P. fluorescens'') di tanah alami tanpa sterilisasi sebelumnya.<ref name=Bowen>{{cite journal |vauthors=Bowen GD, Rovira AD |title= Microbial Colonization of Plant Roots |journal=Annu. Rev. Phytopathol. |date=1976 |volume=14 |pages=121–144|doi= 10.1146/annurev.py.14.090176.001005 }}</ref>
