Pemantauan genetik: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
berkas |
Aryanalian (bicara | kontrib) menambahkan isi dan referensi |
||
Baris 1:
[[Berkas:Mitochondrial DNA lg.jpg|jmpl|[[Mitokondria]] dan [[mikrosatelit]]]]
'''Pemantauan genetik''' adalah penggunaan pernyataan [[fenotipe]] (misalnya warna bulu dan [[Morfologi (biologi)|morfologi]] kerangka)<ref>{{Cite web|title=Genetic Monitoring|url=http://www.dar.emory.edu/vetcare/genetic_monit.php|website=www.dar.emory.edu|access-date=2021-09-08}}</ref> atau [[penanda genetik]] (''genetic marker'') seperti [[mitokondria]], [[DNA mitokondria|MtDNA]], [[:en:Alloenzyme|alozim,]][[mikrosatelit]], dan SNP (''[[Single nucleotide polymorphism|single-nucleotide polymorphism]]'') untuk mengetahui tingkat kemurnian [[genom]] serta perubahan antropogenik pada populasi alami. Pemantauan genetik berperan dalam pendataan perubahan [[Populasi (biologi)|populasi]] dan keanekaragaman [[spesies]] maupun individu. Dalam penelitian, pemantauan genetik digunakan dalam mempersiapkan produksi model penelitian dan pemeliharaan koloni.
== Kategori ==
Baris 6:
=== '''Kategori I''' identifikasi penanda genetik untuk pemantauan populasi tradisional ===
Merupakan penggunaan penanda genetik untuk pemantauan [[populasi tradisional]] melalui identifikasi individu, spesies, dan populasi<ref>{{Cite journal|date=2007-01-01|title=Genetic monitoring as a promising tool for conservation and management|url=https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0169534706002722|journal=Trends in Ecology & Evolution|language=en|volume=22|issue=1|pages=25–33|doi=10.1016/j.tree.2006.08.009|issn=0169-5347}}</ref>. Dibagi kembali menjadi '''kategori Ia''' untuk mengidentifikasi setiap individu dan '''kategori Ib''' untuk mengidentifikasi spesies dan tingkat [[taksonomi]] yang lebih tinggi.
'''Kategori Ia''' menggunakan penanda genetik mikrosatelit dan SNP (''single-nucleotide polymorphism''). Berkas:Petrogale penicillata.JPG|''Petrogale penicillata'' — Brush-tailed Rock-wallaby
Berkas:Grizzly Bear (Ursus arctos ssp.).jpg|''[https://ecos.fws.gov/ecp/species/7642 Ursus arctos horribilis]''
</gallery>
'''Kategori Ib''' menggunakan identifikasi MtDNA, alozim, mikrosatelit, dan SNP (''single-nucleotide polymorphism''). Contoh penggunaan kategori ini adalah dalam mengetahui (i) perubahan jangkauan geografis dan efeknya pada spesies, (ii) persilangan (misalnya persilangan ''[[Bobcat|Lynx rufus]]'' dengan ''[[Lynx kanada|Lynx canadensis]]'' dan ''[https://animaldiversity.org/accounts/Strix_occidentalis/ Strix occidentalis]''dengan ''[https://animaldiversity.org/accounts/Strix_varia/ Strix varia]''), dan (iii) mengidentifikasi penularan dan prevalensi parasit dan organisme [[patogen]] lain.<gallery>
Berkas:Bobcat stare.jpg|[[Bobcat|''Lynx rufus'']]
Berkas:LynxCanadensis.jpg|''[[Lynx kanada|Lynx canadensis]]''
Berkas:Spotted owl 04.jpg|''[[Strix occidentalis]]''
Berkas:Strix varia Tommy Thompson Toronto2.jpg|''Strix varia''
</gallery>
=== '''Kategori II parameter populasi genetik''' ===
Merupakan penggunaan penanda genetik (MtDNA, alozim, mikrosatelit, dan SNP) untuk memantau parameter genetik populasi. Contoh penggunaan kategori II adalah untuk mengetahui (i) variasi genetik, (ii) demografi populasi di alam liar maupun di penangkaran untuk mengetahui status konservasi, (iii) analisis proporsi individu dalam populasi campuran (''mixed-stock''), (iv) melihat aliran gen, (v) identifikasi ukuran populasi efektif (misal pada ''[[:en:Brown_trout|Salmo trutta]]''
Berkas:Salmo trutta fario - Truite fario - Brown trout.jpg|''[[:en:Brown_trout|Salmo trutta]]''
</gallery>
Baris 20 ⟶ 29:
[[Kategori:Biologi konservasi]]
[[Kategori:Genetika populasi]]
<references />{{Cite journal|last=Schwartz|first=M.K.|date=2004|title=Hybridization between bobcats and Canada lynx|url=https://www.researchgate.net/publication/225195035_Hybridization_Between_Canada_Lynx_and_Bobcats_Genetic_Results_and_Management_Implications|journal=Conservation Genetics|volume=5|pages=349–355}}
{{Cite journal|last=Haig|first=S.M.|date=2004|title=Genetic identification of spotted owls, barred owls, and their hybrids: legal implications of hybrid identity.|url=https://doi.org/10.1111/j.1523-1739.2004.00206.x|journal=Conservation Biology|volume=18|pages=1347–1357}}
{{Cite journal|last=Palm|first=Stefan|last2=Laikre|first2=Linda, et al.|date=2003-05-01|title=Effective population size and temporal genetic change in stream resident brown trout (Salmo trutta, L.)|journal=Conservation Genetics|volume=4|issue=3|pages=249-264|doi=10.1023/A:1024064913094}}
Piggott, M.P. et al. (2006) Estimating population size of endangered brush-tailed rock-wallaby (''Petrogale penicillata'') colonies using faecal DNA. ''Mol. Ecol''. 15, 81–91
{{Cite journal|last=Piggott|first=M.P., et al.|date=2006|title=Estimating population size of endangered brush-tailed rock-wallaby (Petrogale penicillata) colonies using faecal DNA|url=https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2005.02783.x|journal=Molecular Ecology|volume=15|issue=1|pages=81–91}}
| |||