Pemantauan genetik: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
Aryanalian (bicara | kontrib)
menambahkan isi dan referensi
Aryanalian (bicara | kontrib)
menambah isi
Baris 1:
[[Berkas:Mitochondrial DNA lg.jpg|jmpl|[[Mitokondria]] dan [[mikrosatelit]]]]
'''Pemantauan genetik''' adalah penggunaan pernyataan [[fenotipe]] (misalnya warna bulu dan [[Morfologi (biologi)|morfologi]] kerangka)<ref>{{Cite web|title=Genetic Monitoring|url=http://www.dar.emory.edu/vetcare/genetic_monit.php|website=www.dar.emory.edu|access-date=2021-09-08}}</ref> atau [[penanda genetik]] (''genetic marker'') seperti [[mitokondria]], [[DNA mitokondria|MtDNA]], [[:en:Alloenzyme|alozim,]][[mikrosatelit]], dan SNP (''[[Single nucleotide polymorphism|single-nucleotide polymorphism]]'') untuk mengetahui tingkat kemurnian [[genom]] serta perubahan antropogenik pada populasi alami. Metode pengambilan sampel yang digunakan dalam pemantauan genetik adalah metode MIS (''minimally invasive sampling'')<ref>{{Cite journal|last=Carroll|first=Emma L.|last2=Bruford|first2=Mike W.|last3=DeWoody|first3=J. Andrew|last4=Leroy|first4=Gregoire|last5=Strand|first5=Alan|last6=Waits|first6=Lisette|last7=Wang|first7=Jinliang|date=2018-03-24|title=Genetic and genomic monitoring with minimally invasive sampling methods|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6050181/|journal=Evolutionary Applications|volume=11|issue=7|pages=1094–1119|doi=10.1111/eva.12600|issn=1752-4571|pmc=6050181|pmid=30026800}}</ref>. Pemantauan genetik berperan dalam pendataan perubahan [[Populasi (biologi)|populasi]] dan keanekaragaman [[spesies]] maupun individu. Dalam penelitian, pemantauan genetik digunakan dalam mempersiapkan produksi model penelitian dan pemeliharaan koloni.
 
== Kategori ==
Baris 6:
 
=== '''Kategori I''' identifikasi penanda genetik untuk pemantauan populasi tradisional ===
Merupakan penggunaan penanda genetik untuk pemantauan [[populasi tradisional]] melalui identifikasi individu, spesies, dan populasi<ref>{{Cite journal|date=2007-01-01|title=Genetic monitoring as a promising tool for conservation and management|url=https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0169534706002722|journal=Trends in Ecology & Evolution|language=en|volume=22|issue=1|pages=25–33|doi=10.1016/j.tree.2006.08.009|issn=0169-5347}}</ref>. Dibagi kembali menjadi '''kategori Ia''' untuk mengidentifikasi setiap individu dan '''kategori Ib''' untuk mengidentifikasi spesies dan tingkat [[taksonomi]] yang lebih tinggi.
 
'''Kategori Ia''' menggunakan penanda genetik mikrosatelit dan SNP (''single-nucleotide polymorphism''). Digunakan dalam (i) penghitungan kelimpahan populasi terutama pada spesies langka dan dilindungi (misalnya ''[https://animaldiversity.org/accounts/Petrogale_penicillata/ Petrogale penicillata]'' dan ''[https://ecos.fws.gov/ecp/species/7642 Ursus arctos horribilis]'') dan (ii) ''vital rates,'' seperti laju kehidupan (''survival rate'').<gallery>
Baris 13:
</gallery>
 
'''Kategori Ib''' menggunakan identifikasi MtDNA, alozim, mikrosatelit, dan SNP (''single-nucleotide polymorphism''). Contoh penggunaan kategori ini adalah dalam mengetahui (i) perubahan jangkauan geografis dan efeknya pada spesies, (ii) persilangan (misalnya persilangan ''[[Bobcat|Lynx rufus]]'' dengan ''[[Lynx kanada|Lynx canadensis]]'' dan ''[https://animaldiversity.org/accounts/Strix_occidentalis/ Strix occidentalis]''dengan ''[https://animaldiversity.org/accounts/Strix_varia/ Strix varia]''), danserta (iii) mengidentifikasi penularan dan prevalensi parasit dan organisme [[patogen]] lainlainnya.<gallery>
Berkas:Bobcat stare.jpg|[[Bobcat|''Lynx rufus'']]
Berkas:LynxCanadensis.jpg|''[[Lynx kanada|Lynx canadensis]]''
Baris 34:
 
{{Cite journal|last=Palm|first=Stefan|last2=Laikre|first2=Linda, et al.|date=2003-05-01|title=Effective population size and temporal genetic change in stream resident brown trout (Salmo trutta, L.)|journal=Conservation Genetics|volume=4|issue=3|pages=249-264|doi=10.1023/A:1024064913094}}
 
Piggott, M.P. et al. (2006) Estimating population size of endangered brush-tailed rock-wallaby (''Petrogale penicillata'') colonies using faecal DNA. ''Mol. Ecol''. 15, 81–91
 
{{Cite journal|last=Piggott|first=M.P., et al.|date=2006|title=Estimating population size of endangered brush-tailed rock-wallaby (Petrogale penicillata) colonies using faecal DNA|url=https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2005.02783.x|journal=Molecular Ecology|volume=15|issue=1|pages=81–91}}