Varian Alpha SARS-CoV-2: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
DESTROY B.1.630 VARIANT!!! PREVENT ITS RISE!!! |
Membalikkan revisi 19257266 oleh 88.231.54.137 (bicara) Tag: Pembatalan |
||
Baris 42:
Salah satu perubahan penting pada varian ini adalah N501Y,<ref>{{cite journal |last=Wise |first=Jacqui |date=5 Februari 2021 |title=Covid-19: The E484K mutation and the risks it poses |journal=[[The BMJ]] |volume=372 |page=n359 |issn=1756-1833 |s2cid=231821685 |doi=10.1136/bmj.n359 |doi-access=free |url=https://www.bmj.com/content/372/bmj.n359 |language=en}}</ref> yaitu perubahan dari [[asparagina]] (N) menjadi [[tirosina]] (Y) pada posisi [[asam amino]] 501.<ref>{{cite report |title=COG-UK update on SARS-CoV-2 Spike mutations of special interest: Report 1 |date=20 Desember 2020 |publisher=COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK) |page=7 |url=https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2-Mutations_final_updated2.pdf |access-date=31 Desember 2020 |archive-url=https://web.archive.org/web/20201225050316/https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2-Mutations_final_updated2.pdf |archive-date=25 Desember 2020 |url-status=dead |language=en}}</ref> Mutasi ini diyakini dapat meningkatkan kemampuan virus untuk mengikat sel manusia.<ref name="Chand2020" />
=== Genetika ===
{{plain image with caption|image=SARS-CoV-2 Alpha variant.svg|width=1024|align=center|triangle=triangle|triangle color=#1abc31|caption=Mutasi asam amino varian Alpha SARS-CoV-2 yang dipetakan pada peta genom SARS-CoV-2 dengan sorotan pada bagian bulir}}
{| class="wikitable mw-collapsible autocollapse" align="right" style="max-width: 420px; text-align: center;"
|+ {{nowrap|Mutasi pada varian Alpha}}<br />(hanya yang mengubah asam amino)<br />
! [[Gen]]
! [[Nukleotida]]
! [[Asam amino]]
|-
! rowspan="4" | [[Rangka baca terbuka|ORF1ab]]
| C3267T || T1001I
|-
| C5388A || A1708D
|-
| T6954C || I2230T
|-
| 11288–11296 dihapus || SGF3675–3677hapus
|-
! rowspan="8"| [[Bulir (virus)|Bulir]]
| 21765–21770 dihapus || HV69–70hapus
|-
| 21991–21993 dihapus || Y144hapus
|-
| A23063T || N501Y
|-
| C23271A || A570D
|-
| C23604A || P681H
|-
| C23709T || T716I
|-
| T24506G || S982A
|-
| G24914C || D1118H
|-
! rowspan="3" | ORF8
| C27972T || Q27stop
|-
| G28048T || R52I
|-
| A28111G || Y73C
|-
! rowspan="2" | [[Kapsid|N]]
| 28280 GAT→CTA || D3L
|-
| C28977T || S235F
|- style="font-size: smaller; text-align: left;" class="sortbottom"
| colspan="3" | Sumber: Chand dkk. (2020),<ref name="Chand2020" /> tabel{{nbsp}}1, hlm.{{nbsp}}5
|- style="font-size: smaller; text-align: left;" class="sortbottom"
| colspan="3" | Catatan: N501Y berarti perubahan dari [[asparagina]] (N) menjadi [[tirosina]] (Y) pada posisi [[asam amino]] 501.<ref>Untuk daftar simbol asam amino α yang dipakai dalam protein sesuai arahan RNA duta, lihat ini: {{cite web |url=http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/AminoAcid/AA1n2.html |title=Nomenclature and Symbolism for Amino Acids and Peptides |year=1983 |publisher=IUPAC-IUB Joint Commission on Biochemical Nomenclature |access-date=5 Maret 2018 |archive-url=https://web.archive.org/web/20081009023202/http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/AminoAcid/AA1n2.html |archive-date=9 Oktober 2008 |url-status=dead |language=en}}</ref>
|}
[[Mutasi]] pada [[Koronavirus sindrom pernapasan akut berat 2|SARS-CoV-2]] cukup sering: lebih dari empat ribu mutasi telah dideteksi hanya pada bulir proteinnya menurut [[Konsorsium Britania Raya untuk Genom COVID-19]].<ref>{{cite journal |last=Wise |first=Jacqui |date=16 Desember 2020 |title=Covid-19: New coronavirus variant is identified in UK |journal=[[The BMJ]] |volume=371 |pages=m4857 |issn=1756-1833 |s2cid=229291003 |doi=10.1136/bmj.m4857 |doi-access=free |url=https://www.bmj.com/content/371/bmj.m4857 |language=en}}</ref>
Varian ini terdiri dari 23 mutasi: 14 mutasi tak bersinonim, 3 mutasi hapus, dan 6 mutasi bersinonim,<ref name="Chand2020" /> yaitu 17 mutasi yang mengubah protein dan 6 mutasi yang tidak berdampak.<ref>{{cite book |last1=Rachmawati |first1=Faidah |last2=Urifah |first2=Nurul |last3=Wijayati |first3=Ari |year=2009 |title=Biologi untuk SMA/MA Kelas XII Program IPA |location=Jakarta |publisher=Pusat Perbukuan Departemen Pendidikan Nasional}}</ref>
== Efektivitas vaksin ==
| |||