Fausto Gresini mendirikan tim pada tahun 1997 dengan Fabrizio Cecchini sebagai direktur teknis. Tim tersebut berkompetisi di kelas 500 cc dengan pebalap Brasil [[Alex Barros]] dengan mengendarai Honda [[NSR500V]]. Barros menempati peringkat kesembilan di klasemen akhir kejuaraan, dan berhasil mencatatkan podium pertama tim di [[Donington Park]]. Tahun berikutnya, Honda memutuskan untuk memasok Barros dan tim dengan sepeda empat silinder Honda [[NSR500]], sepeda yang sama yang digunakan oleh tim pabrikan. Barros mencatatkan dua kali finis podium dan serangkaian finis lima besar untuk mengumpulkan 138 poin dan menempati posisi kelima di klasemen akhir. Pada tahun 1999, tim turun ke kelas 250 cc dengan Honda [[NSR250]] yang didukung pabrikan dengan juara dunia 250cc saat itu [[Loris Capirossi]] sebagai pembalap. Pada balapan pertama musim tersebut di [[Sirkuit Sepang|Sepang]], [[Malaysia]], Capirossi meraih kemenangan pertama bagi tim Gresini. Selama semusim, ia memperoleh dua kemenangan dan enam podium, dan menyelesaikan musim ketiga di klasemen akhir dengan 209 poin
[[Berkas:Honda NSR250 2001.jpg|jmpl|Setelah Capirossi naik ke kelas 500 cc untuk musim 2000, tim mengontrak pebalap muda Jepang Daijiro Kato dan pebalap Prancis Vincent Philippe. Kato, yang telah memenangkan dua balapan sebagai pembalap wild-card pada tahun 1997 dan 1998, membuat dampak instan dengan empat kali naik podium berturut-turut di awal musim. Ia menjadi penantang gelar untuk gelar 250 cc bersama dengan pembalap Yamaha Shinya Nakano dan Olivier Jacque hingga balapan terakhir musim ini di Phillip Island, Australia. Namun, Kato finis ketiga dalam perlombaan dan kehilangan gelar dan posisi runner-up masing-masing dari Jacque dan Nakano. 259 poin Kato dan tempat ketiga di kejuaraan memberinya penghargaan Rookie of the Year di kelas 250cc.
