Pengasuh Pondok Pesantren dibawah Yayasan Nur Hidayah Balikpapan adalah KH.Ustadzah Moh.Nur S. Fajar AliHidayah, S.Pd.I.sebagai Sebelumpengganti memimpinpengasuh Pondoksebelumnya Pesantrenyang Nurtersandung Hidayah,kasus Kyaikriminal Fajarsehingga Alibisa sudahYayasan aktifmenonaktifkan dalamyang kegiatanbersangkutan rutinuntuk bulanankeperluan didalam Majelis Taklim Nur Hidayah Balikpapanpenyelidikan. Ketua Yayasan Nur Hidayah Balikpapan adalah Ahmad Jumaliki, SH yang juga Ketua Umum Majelis Nur Hidayah Balikpapan.<ref name="nurhidayah">_. 2015. ''[https://kaltim.prokal.co/read/news/247830-jalan-sehat-bareng-warga Jalan Sehat Bareng Warga]''. Kaltim Prokal. Akses 18 April 2021</ref>
KH. Moh. S. Fajar Ali termasuk da'i di Kota Balikpapan sekaligus tokoh [[Graha NU Balikpapan|NU Balikpapan]]. Ia adalah Wakil Rais Syuriyah [[Graha NU Balikpapan|PCNU Balikpapan]] didalam Struktur Pengurus Cabang Nahdlatul Ulama Balikpapan Tahun 2012-2017<ref name="nubalikpapan2">_. 2013. ''[https://web.archive.org/web/20180612140544/http://nubalikpapan.id/struktur-pengurus-cabang-nu-kota-balikpapan-2012-2017/ Struktur Pengurus Cabang NU Kota Balikpapan 2012-2017]''. NUBalikpapan.ID via Wayback Machine. Akses 18 April 2021</ref> dan Tahun 2017-2022.<ref name="nubalikpapan3">_. 2018. ''[https://web.archive.org/web/20180619225044/http://nubalikpapan.id/struktur-pengurus-cabang-nu-balikpapan-2017-2022/ Struktur Pengurus Cabang NU Balikpapan 2017-2022]''. NUBalikpapan.ID via Wayback Machine. Akses 18 April 2021</ref> Sementara dalam Struktur [[Graha NU Balikpapan|PCNU Balikpapan]] pada tahun sebelumnya, Tahun 2007-2012, Kyai Fajar Ali termasuk salah satu A'wan [[Graha NU Balikpapan|PCNU Balikpapan]].<ref name="nubalikpapan">_. 2013. ''[https://web.archive.org/web/20180612142915/http://nubalikpapan.id/pengurus-nu-balikpapan-periode-2007-2012/ Pengurus NU Balikpapan Periode 2007-2012]''. NUBalikpapan.ID via Wayback Machine. Akses 18 April 2021</ref> Kyai Fajar juga termasuk anggota Komisi Hukum, Fatwa dan Perundang-Undangan didalam Stuktur [[Majelis Ulama Indonesia]] (MUI) [[Kota Balikpapan]] Tahun 2016-2021.<ref name="tribun">_. 2019. ''[https://kaltim.tribunnews.com/2019/03/26/kabar-duka-ketua-mui-kota-balikpapan-kh-a-syarwani-zuhri-meninggal-dunia?page=all Ketua Umum MUI Kota Balikpapan KH Ahmad Syarwani Zuhri Meninggal Dunia. Tribun Kaltim]''. Akses 18 April 2021.</ref>
== Afiliasi ==
Secara paham keagamaan, Pondok Pesantren Nur Hidayah Balikpapan berafiliasi kepada ormas Islam terbesar di Indonesia yaitu [[Nahdlatul Ulama]]. [[Pesantren|Pondok Pesantren]] tersebut mengajarkan kitab-kitab keagamaan [[Suni|Ahlussunnah wal Jama'ah]] dan menganut [[Mazhab|madzhab]] tertentu. Diantara [[kitab kuning]] yang diajarkan adalah Aqidatul 'Awam (aqidah), Akhlaqul Lil-Banin wal Banat, Al-Arba'in [[Abu Zakaria Muhyuddin an-Nawawi|An-Nawawiyah]], Lubabul Hadits, Mabadiul Fiqhiyyah, Ghayatul Ikhtishar (At-Taqrib/ Matan Abu Syuja), Nurul Yaqin (sejarah), dan lain sebagainya. Sedangkan amaliyah rutinnya adalah Maulid Al-Habsyi, Ratibul Haddad, [[Tahlil]], Istighatsah, Khithabah dan lain sebagainya.<ref name="komikus">_. 2020. ''[https://komikusbalikpapan.wordpress.com/2020/05/04/pondok-pesantren-modern-nur-hidayah-balikpapan/ Pondok Pesantren Modern Nur Hidayah Balikpapan.]'' Komikus Balikpapan. Akses 18 April 2021</ref>
