Per 10 Maret 2021, kereta api Kertanegara beroperasi menggunakan rangkaian kereta baja nirkarat buatan PT INKA dengan susunan lima kereta kelas eksekutif, tiga kereta kelas ekonomi premium, satu kereta makan (M), dan satu kereta pembangkit (P).<ref name="REGKOMPAS">{{Cite web|last=Zain|first=Fadlan Mukhtar|date=2021-03-08|title=Rabu, PT KAI Luncurkan KA Kertanegara Relasi Purwokerto-Malang PP|url=https://regional.kompas.com/read/2021/03/08/103706978/rabu-pt-kai-luncurkan-ka-kertanegara-relasi-purwokerto-malang-pp|website=KOMPAS.com|language=id|access-date=2021-03-10}}</ref>
Per 26 Januari 2022, Keretakereta api Kertanegara beroperasimengalami menggunakanpergantian rangkaian keretadari rangkaian baja nirkarat menjadi ''mild steel''. Kertanegara menggunakan kereta kelas eksekutif angkatanbuatan tahun 1968 s.d 20091968—2009, sedangkan kelas ekonomi plus menggunakan rangkaian buatan [[Industri Kereta Api (perusahaan)|PT INKA]] tahun 2016 dihibahkanmilik dariDepo [[Kereta apiBandung Argoyang Parahyangan]]sebelumnya milikdigunakan Depooleh [[Kereta Bandungapi (BD),Argo SementaraParahyangan|Argo rangkaianParahyangan]]. keretaRangkaian baja nirkarat buatanyang PTsemula INKAdigunakan oleh Kertanegara akan dihibahkandigunakan keoleh [[Keretakereta api Gajahwong]] untuk beroperasi pada Tanggalmulai 1 Februari 2022.<ref>{{Cite web|last=Farozy|first=Ikko Haidar|date=2022-01-30|title=KAI Modifikasi Kereta Ekonomi 2016 Menjadi Ala Premium, Inilah Wujudnya|url=https://redigest.web.id/2022/01/kai-modifikasi-kereta-ekonomi-2016-menjadi-ala-premium-inilah-wujudnya/|website=Railway Enthusiast Digest|language=id-ID|access-date=2022-01-30}}</ref>
