Setelah penghentian obat serotonergik, sebagian besar kasus sindrom serotonin sembuh dalam waktu 24 jam,<ref>{{Cite journal|last=Prator|first=Bettina C.|date=2006-04|title=Serotonin syndrome|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16681290|journal=The Journal of Neuroscience Nursing: Journal of the American Association of Neuroscience Nurses|volume=38|issue=2|pages=102–105|doi=10.1097/01376517-200604000-00005|issn=0888-0395|pmid=16681290}}</ref> meskipun dalam beberapa kasus [[delirium]] dapat bertahan selama beberapa hari.<ref>{{Cite journal|last=Sternbach|first=H.|date=1991-06|title=The serotonin syndrome|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/2035713|journal=The American Journal of Psychiatry|volume=148|issue=6|pages=705–713|doi=10.1176/ajp.148.6.705|issn=0002-953X|pmid=2035713}}</ref> Gejala biasanya bertahan untuk jangka waktu yang lebih lama pada pasien yang memakai obat yang memiliki [[waktu paruh]] eliminasi yang lama, metabolit aktif, atau durasi kerja yang berkepanjangan.<ref name = Boyer/>
Kasus telah melaporkan gejala kronis yang bertahan,<ref>{{Cite journal|last=ChechaniAbles|first=VijayAdrienne Z.|last2=Nagubilli|first2=Raju|date=20022010-0205-01|title=SerotoninPrevention, syndrome presenting as hypotonic comaRecognition, and apnea: potentially fatal complicationsManagement of selective serotonin receptor inhibitorSerotonin therapySyndrome|url=https://pubmedwww.ncbiaafp.nlmorg/afp/2010/0501/p1139.nih.gov/11889332html|journal=CriticalAmerican CareFamily MedicinePhysician|volume=3081|issue=29|pages=473–476|doi=10.1097/00003246-200202000-000331139–1142|issn=00900002-3493|pmid=11889332838X}}</ref> dan penghentian antidepresan dapat berkontribusi pada fitur yang sedang berlangsung.<ref>{{Cite journal|last=Gabriel|first=Matthew|last2=Sharma|first2=Verinder|date=2017-05-29|title=Antidepressant discontinuation syndrome|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28554948|journal=CMAJ: Canadian Medical Association journal = journal de l'Association medicale canadienne|volume=189|issue=21|pages=E747|doi=10.1503/cmaj.160991|issn=1488-2329|pmc=5449237|pmid=28554948}}</ref> Setelah manajemen medis yang tepat, sindrom serotonin umumnya dikaitkan dengan prognosis yang baik.<ref>{{Cite journal|last=Mason|first=P. J.|last2=Morris|first2=V. A.|last3=Balcezak|first3=T. J.|date=2000-07|title=Serotonin syndrome. Presentation of 2 cases and review of the literature|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10941349|journal=Medicine|volume=79|issue=4|pages=201–209|doi=10.1097/00005792-200007000-00001|issn=0025-7974|pmid=10941349}}</ref>
