Kompleks eksosom: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
Tag: Suntingan visualeditor-wikitext
Tag: Suntingan visualeditor-wikitext
Baris 35:
Eksosom terlibat dalam degradasi dan [[modifikasi pascatranskripsi]] berbagai molekul RNA. Dalam [[sitoplasma]], eksosom terlibat dalam pergantian molekul [[RNA duta|messenger RNA]] (mRNA). Kompleks tersebut dapat mendegradasi molekul mRNA yang telah ditandai karena mengandung kesalahan, melalui interaksi dengan protein dari jalur peluruhan tanpa henti. Cara lainnya, mRNA terdegradasi sebagai bagian dari [[RNA duta|pergantian normal]]. Beberapa protein yang menstabilkan atau mendestabilisasi molekul mRNA melalui pengikatan pada elemen kaya AU pada ''3' untranslated region'' (UTR) berinteraksi dengan kompleks eksosom.<ref>{{Cite journal|last=LeJeune|first=F|last2=Li|first2=X|last3=Maquat|first3=LE|year=2003|title=Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities|journal=Molecular Cell|volume=12|issue=3|pages=675–87|doi=10.1016/S1097-2765(03)00349-6|pmid=14527413}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Wilson|first=MA|last2=Meaux|first2=S|last3=Van Hoof|first3=A|year=2007|title=A genomic screen in yeast reveals novel aspects of nonstop mRNA metabolism|journal=Genetics|volume=177|issue=2|pages=773–84|doi=10.1534/genetics.107.073205|pmc=2034642|pmid=17660569}}</ref><ref>{{Cite journal|last=Lin|first=WJ|last2=Duffy|first2=A|last3=Chen|first3=CY|year=2007|title=Localization of AU-rich element-containing mRNA in cytoplasmic granules containing exosome subunits|journal=Journal of Biological Chemistry|volume=282|issue=27|pages=19958–68|doi=10.1074/jbc.M702281200|pmid=17470429}}</ref> Dalam [[Inti sel|nukleus]], eksosom diperlukan untuk pemrosesan beberapa molekul RNA nuklir kecil secara tepat.<ref name="sRNA">{{Cite journal|last=Allmang|first=C|last2=Kufel|first2=J|last3=Chanfreau|first3=G|last4=Mitchell|first4=P|last5=Petfalski|first5=E|last6=Tollervey|first6=D|year=1999|title=Functions of the exosome in rRNA, snoRNA and snRNA synthesis|journal=EMBO Journal|volume=18|issue=19|pages=5399–410|doi=10.1093/emboj/18.19.5399|pmc=1171609|pmid=10508172}}</ref> Sementara [[nukleolus]] merupakan kompartemen tempat sebagian besar kompleks eksosom ditemukan. Kompleks eksosom memainkan peran dalam pemrosesan [[RNA ribosomal|RNA ribosom]] 5.8S (fungsi eksosom yang pertama kali diketahui) dan beberapa RNA nukleolar kecil.<ref name="Mitchell2">{{Cite journal|last=Mitchell|first=P|last2=Petfalski|first2=E|last3=Shevchenko|first3=A|last4=Mann|first4=M|last5=Tollervey|first5=D|year=1997|title=The Exosome: A Conserved Eukaryotic RNA Processing Complex Containing Multiple 3′→5′ Exoribonucleases|journal=[[Cell (journal)|Cell]]|volume=91|issue=4|pages=457–466|doi=10.1016/S0092-8674(00)80432-8|pmid=9390555}}</ref><ref name="sRNA" /><ref>{{Cite journal|last=Schilders|first=G|last2=Raijmakers|first2=R|last3=Raats|first3=JM|last4=Pruijn|first4=GJ|year=2005|title=MPP6 is an exosome-associated RNA-binding protein involved in 5.8S rRNA maturation|journal=Nucleic Acids Research|volume=33|issue=21|pages=6795–804|doi=10.1093/nar/gki982|pmc=1310903|pmid=16396833}}</ref>
 
Meskipun sebagian besar sel memiliki enzim lain yang dapat mendegradasi RNA, baik dari ujung 3' atau dari ujung 5', kompleks eksosom sangat penting untuk kelangsungan hidup sel. Ketika [[Ekspresi gen|ekspresi]] protein eksosom dikurangi atau dihentikan secara artifisial (misalnya dengan [[interferensi RNA]]), pertumbuhan sel berhenti dan akhirnya sel mati. Protein inti dari kompleks eksosom serta dua protein partner utama, merupakan protein esensial.<ref>{{Cite journal|last=van Dijk|first=EL|last2=Schilders|first2=G|last3=Pruijn|first3=GJ|year=2007|title=Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways|journal=RNA|volume=13|issue=7|pages=1027–35|doi=10.1261/rna.575107|pmc=1894934|pmid=17545563}}</ref> [[Bakteri]] tidak memiliki kompleks eksosom, tetapi fungsi serupa dilakukan oleh kompleks yang lebih sederhana yang mencakup protein PNPase yang disebut ''degradosome''.<ref>{{Cite journal|last=Carpousis AJ|first=AJA. J.|yeardate=2002-04-01|title=The Escherichia coli RNA degradosome: structure, function and relationship into other ribonucleolytic multienzymemultienyzme complexes|journalurl=Biochemhttps://www. Socresearchgate.net/publication/11336396_The_Escherichia_coli_RNA_degradosome_structure_function_and_relationship_to_other_ribonucleolytic_multienyzme_complexes|journal=Biochemical Trans.Society Transactions|language=en|volume=30|issue=2|pages=150–5150–155|doi=10.1042/BST0300150bst0300150|pmidissn=120357600300-5127}}</ref>
 
Eksosom berperan dalam pemrosesan RNA, kegiatan pergantian dan pengawasan, dan juga penting untuk degradasi ''cryptic unstable transcript'' (CUT) yang dihasilkan dari ribuan lokus dalam genom ragi.<ref>{{Cite journal|last=Wyers F|first=F|last2=Rougemaille|first2=M|last3=Badis|first3=G|last4=Rousselle|first4=JC|last5=Dufour|first5=ME|last6=Boulay|first6=J|last7=Régnault|first7=B|last8=Devaux|first8=F|last9=Namane|first9=A|displayauthors=3|date=June 2005|title=Cryptic pol II transcripts are degraded by a nuclear quality control pathway involving a new poly(A) polymerase|journal=Cell|volume=121|issue=5|pages=725–37|doi=10.1016/j.cell.2005.04.030|pmid=15935759}}</ref><ref>{{Cite journal|date=February 2009|title=Widespread bidirectional promoters are the major source of cryptic transcripts in yeast|journal=Nature|volume=457|issue=7232|pages=1038–42|bibcode=2009Natur.457.1038N|doi=10.1038/nature07747|pmid=19169244|vauthors=Neil H, Malabat C, d'Aubenton-Carafa Y, Xu Z, Steinmetz LM, Jacquier A}}</ref> Pentingnya RNA tidak stabil ini dan degradasinya masih belum jelas, tetapi molekul RNA serupa juga telah terdeteksi dalam sel manusia.<ref>{{Cite journal|last=Preker P|first=P|last2=Nielsen|first2=J|last3=Kammler|first3=S|last4=Lykke-Andersen|first4=S|last5=Christensen|first5=MS|last6=Mapendano|first6=CK|last7=Schierup|first7=MH|last8=Jensen|first8=TH|displayauthors=3|date=December 2008|title=RNA exosome depletion reveals transcription upstream of active human promoters|journal=Science|volume=322|issue=5909|pages=1851–4|bibcode=2008Sci...322.1851P|doi=10.1126/science.1164096|pmid=19056938}}</ref>