Masyumi pada awalnya merupakan sebuah organisasi Islam yang berada dalam pengawasan pemerintah pendudukan Jepang di Indonesia. Organisasi ini didirikan pada tanggal 24 Oktober 1943 sebagai pengganti [[MIAI]] (Madjlisul Islamil A'laa Indonesia). karenaTujuan Jepangpembentukan memerlukanMasyumi suatusebagai badansarana untukpenghimpun menggalangmasyarakat dukunganmuslim masyarakatdi Indonesia melaluiuntuk lembagadijadikan agamasebagai Islampasukan pendukung Jepang dalam [[Perang Pasifik]].<ref>{{Cite book|last=Qodir, Z., dkk.|date=2020|url=http://repository.umy.ac.id/bitstream/handle/123456789/32609/ISI%20MR%20KASMAN-FIX-OK_compressed.pdf?sequence=1&isAllowed=y|title=Nasionalis Tulen Singa Podium Kasman Singodimedjo: Pemikiran dan Pergerakan|location=Yogyakarta|publisher=Jusuf Kalla School of Government|isbn=978-602-73900-8-9|editor-last=Budiyanto, G., dkk.|pages=75-76|url-status=live}}</ref> Meskipun demikian, Jepang tidak terlalu tertarik dengan partai-partai Islam yang telah ada pada zaman Belanda yang kebanyakan berlokasi di perkotaan dan berpola pikir modern, sehingga pada minggu-minggu pertama, Jepang telah melarang [[Sarekat Islam|Partai Sarekat Islam Indonesia]] (PSII) dan [[Partai Islam Indonesia]] (PII). Selain itu Jepang juga berusaha memisahkan golongan cendekiawan Islam di perkotaan dengan para kyai di pedesaan. Para kyai di pedesaan memainkan peranan lebih penting bagi Jepang karena dapat menggerakkan masyarakat untuk mendukung Perang Pasifik, sebagai buruh maupun tentara. Setelah gagal mendapatkan dukungan dari kalangan nasionalis di dalam [[Putera]] (Pusat Tenaga Rakyat), akhirnya Jepang mendirikan Masyumi.
Masyumi pada zaman pendudukan [[Jepang]] belum menjadi partai namun merupakan federasi dari empat organisasi Islam yang diizinkan pada masa itu, yaitu [[Nahdlatul Ulama]] (NU), [[Muhammadiyah]], [[Persatuan Umat Islam]], dan [[Persatuan Umat Islam Indonesia]].<ref>{{Cite web |url=http://www.al-shia.com/html/id/service/Info-Universitas/universitas%20Islam%20Indonesia.htm |title=Sejarah Singkat Universitas Islam Indonesia |access-date=2007-02-03 |archive-date=2007-03-12 |archive-url=https://web.archive.org/web/20070312092913/http://www.al-shia.com/html/id/service/Info-Universitas/universitas%20Islam%20Indonesia.htm |dead-url=yes }}</ref>