Rusli Zainal menikah dengan Septina Primawati dan memiliki tiga yang pada saat sidang status anak-anak tersebut dipertentangkan apakah anak kandung mereka, anak angkat, atau anak hasil perkawinan Rusli Zainal dari wanita lain.<ref name="Mata News">{{Cite web |url=http://matanews.com/2012/01/12/yusril-singgung-rusli-zainal/ |title=Mata News |access-date=2012-08-14 |archive-date=2012-07-01 |archive-url=https://web.archive.org/web/20120701141903/http://matanews.com/2012/01/12/yusril-singgung-rusli-zainal/ |dead-url=yes }}</ref><ref>[http://bertuahvoice.com/fakta-sidang-mk-septina-bukan-satu-satunya-istri-rusli-zainal/pekanbaru.html Bertuah Voice]{{Pranala mati|date=Juni 2021 |bot=InternetArchiveBot |fix-attempted=yes }}</ref> Pada saat persidangan sengeketa pemilihan kepala daerah [[Kota Pekanbaru]] yang diikuti oleh Septina Primawati, menurut [[Yusril Ihza Mahendra]], kuasa hukum lawan dari pasangan Septima Promawati dan Erizal Muluk mengatakan bahwa Rusli Zainal juga memilki tiga istri lainnya yang dinikahi secara hukum [[Islam]] dan ada yang tercatat dan ada pula yang tidak tercatat.<ref name="Mata News" />
=== Pasca menjadi tersangka ===
Setelah ditetapkan menjadi tersangka oleh Komisi Pemberantasan Korupsi, Rusli Zainal langsung dinonaktifkan oleh partai [[Golkar]].<ref>[http://news.okezone.com/read/2013/02/08/339/758998/jadi-tersangka-golkar-nonaktifkan-rusli-zainal Golkar nonaktifkan Rusli Zainal]</ref> Selain itu partai [[Golkar]] tidak akan membantu Rusli Zainal dan tidak akan membela dan menyediakan penasehat hukum bagi Rusli Zainal.<ref>[http://nasional.kompas.com/read/2013/02/08/22373543/Partai.Golkar.Biarkan.Rusli.Zainal.Hadapi.Proses.Hukum Golkar biarkan Rusli Zainal hadapi hukum]</ref> Elit partai [[Golkar]] juga mengkhawatirkan turunnya popularitas partai [[Golkar]] akibat ditetapkanya Rusli Zainal sebagai tersangka.<ref>[http://news.detik.com/read/2013/02/08/150658/2164976/10/rusli-zainal-tersangka-golkar-khawatir-popularitas-turun?9911012 Rusli Zainal tersangka, Golkar khawatirkan popularitas turun]</ref>
Pada [[14 Juni]] [[2013]], Rusli Zainal akhirnya ditahan di [[Rumah Tahanan|Rutan]] [[Komisi Pemberantasan Korupsi]] untuk masa penahanan 20 hari pertama. Penahanan dirinya terkait dengan tiga perkara tindak pidana korupsi.<ref>[http://www.republika.co.id/berita/nasional/hukum/13/06/14/modo5h-rusli-zainal-ditahan-di-rutan-kpk Rusli Zainal Ditahan di Rutan KPK]</ref> Terkait dengan penahanan Rusli, Mendagri Gamawan Fauzi mengatakan, tugas gubernur dijalankan oleh wakil gubernur sampai Rusli Zainal resmi dinonaktifkan.<ref>[http://www.tempo.co/read/news/2013/06/14/063488417/Ditahan-Tugas-Rusli-Zainal-Digantikan-Wagub Tugas Rusli Zainal Digantikan Wagub]</ref>
