Nukleosida trifosfat: Perbedaan antara revisi

Sebuah '''nukleosida trifosfat''' adalah [[molekul]] yang mengandung [[Basa nukleotida|basa nitrogen]] terikat pada gula 5-karbon (baik [[Ribosom|ribosa]] atau [[deoksiribosa]]), dengan tiga gugus [[Ortofosfat|fosfat]] terikat pada [[gula]].<ref>{{Cite journal|date=2008-11-28|title=PLoS Genetics Issue Image {{!}} Vol. 4(11) November 2008|url=http://dx.doi.org/10.1371/image.pgen.v04.i11|journal=PLoS Genetics|volume=4|issue=11|pages=ev04.i11|doi=10.1371/image.pgen.v04.i11|issn=1553-7404}}</ref>Ini adalah contoh nukleotida. Mereka adalah prekursor molekul [[Asam deoksiribonukleat|DNA]] dan [[Asam ribonukleat|RNA]], yang merupakan rantai nukleotida yang dibuat melalui proses [[Replikasi DNA|replikasi]] dan [[Transkripsi|transkripsi DN]]A.<ref>{{Cite book|date=1960|url=https://www.worldcat.org/oclc/820457150|title=The nucleic acids. Volume III|location=New York|publisher=Academic Press|isbn=978-0-323-14477-3|others=Erwin Chargaff, J. N. Davidson|oclc=820457150}}</ref> Trifosfat nukleosida juga berfungsi sebagai sumber energi untuk reaksi seluler <ref>{{Cite journal|date=2017-11|title=PS1 Original focuses on increased efficiency|url=http://dx.doi.org/10.1016/s0262-1762(18)30019-1|journal=World Pumps|volume=2017|issue=11|pages=11|doi=10.1016/s0262-1762(18)30019-1|issn=0262-1762}}</ref> dan terlibat dalam jalur sinyal.<ref>{{Cite journal|last=Seybold|first=Patricia|date=2011-03|title=Nature's Scitable: Going Mobile|url=http://dx.doi.org/10.1571/cs03-31-11cc|location=Boston, MA}}</ref>

 

Nukleosida trifosfat tidak dapat diserap dengan baik, sehingga biasanya disintesis di dalam [[sel]].<ref>{{Cite book|url=http://dx.doi.org/10.5040/9781472927002.0277|title=Melignomon eisentrauti Louette. Yellow-footed Honeyguide; Eisentraut’s Honeyguide; Coe’s Honeyguide. Indicateur de Eisentraut.|publisher=Academic Press Limited}}</ref> Jalur sintesis berbeda tergantung pada [[nukleosida]] trifosfat spesifik yang dibuat, tetapi mengingat banyak peran penting nukleosida trifosfat, sintesis diatur secara ketat dalam semua kasus.<ref>{{Cite journal|last=Wyngaarden|first=James B.|date=1976-01|title=Regulation of purine biosynthesis and turnover|url=http://dx.doi.org/10.1016/0065-2571(76)90006-6|journal=Advances in Enzyme Regulation|volume=14|pages=25–42|doi=10.1016/0065-2571(76)90006-6|issn=0065-2571}}</ref> [[Analog nukleosida]] juga dapat digunakan untuk mengobati infeksi [[virus]].<ref>{{Cite journal|last=Galmarini|first=CM|last2=Mackey|first2=JR|last3=Dumontet|first3=C|date=2001-06|title=Nucleoside analogues: mechanisms of drug resistance and reversal strategies|url=http://dx.doi.org/10.1038/sj.leu.2402114|journal=Leukemia|volume=15|issue=6|pages=875–890|doi=10.1038/sj.leu.2402114|issn=0887-6924}}</ref> Misalnya, azidothymidine (AZT) adalah analog [[nukleosida]] yang digunakan untuk mencegah dan mengobati [[HIV/AIDS]].<ref>{{Cite journal|date=2017-11-30|title=Grain Transportation Report, November 30, 2017|url=http://dx.doi.org/10.9752/ts056.11-30-2017}}</ref>

== Penamaan ==

Istilah nukleosida mengacu pada basa nitrogen terkait dengan gula 5-karbon (baik ribosa atau deoksiribosa).<ref>{{Cite book|last=Carlyle|first=Thomas|url=http://dx.doi.org/10.1017/cbo9780511694677.004|title=CROWN-PRINCE RETRIEVED: LIFE AT CUSTRIN NOVEMBER 1730-FEBRUARY 1732|location=Cambridge|publisher=Cambridge University Press|pages=342–406}}</ref>Nukleutida adalah nukleosida yang terikat secara kovalen dengan satu atau lebih gugus fosfat.<ref>{{Cite journal|last=Secrist|first=Jack|date=2005-09-01|title=John A. Montgomery, March 29, 1924–May 24, 2004|url=http://dx.doi.org/10.1080/15257770500482340|journal=Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids|volume=24|issue=10-12|pages=1387–1394|doi=10.1080/15257770500482340|issn=1525-7770}}</ref> Untuk memberikan informasi tentang jumlah fosfat, nukleotida dapat disebut sebagai nukleosida (mono, di, atau tri) fosfat. Jadi, nukleosida trifosfat adalah jenis nukleotida.<ref>{{Cite book|last=compiler.|first=Favre, Henri A., compiler. Powell, Warren H., 1934-|date=2014|url=http://worldcat.org/oclc/865143943|title=Nomenclature of Organic Chemistry : IUPAC Recommendations and Preferred Names 2013|publisher=Royal Society of Chemistry|isbn=978-1-84973-306-9|oclc=865143943}}</ref>

 

Karbon gula dalam nukleosida trifosfat diberi nomor di sekitar cincin karbon mulai dari karbonil asli gula. Secara konvensional, nomor karbon dalam gula diikuti dengan simbol prima (‘) untuk membedakannya dari karbon basa nitrogen. Basa nitrogen dihubungkan dengan karbon 1 'melalui ikatan glikosidik, dan gugus fosfat terikat secara kovalen dengan karbon 5'.<ref>{{Cite book|last=M.|first=Kevin|date=2011-09-26|url=http://dx.doi.org/10.5772/19486|title=DNA Replication in Repair|publisher=InTech}}</ref> Gugus fosfat pertama yang terikat dengan gula disebut -fosfat, yang kedua adalah -fosfat, dan yang ketiga adalah -fosfat.<ref>{{Cite journal|last=Sepielli|first=Andrew|date=2013-01-24|title=What to Do When You Don't Know What to Do When You Don't Know What to Do…|url=http://dx.doi.org/10.1111/nous.12010|journal=Noûs|volume=48|issue=3|pages=521–544|doi=10.1111/nous.12010|issn=0029-4624}}</ref>

== DNA and RNA synthesis ==

Proses seluler replikasi dan transkripsi DNA melibatkan sintesis DNA dan RNA, masing-masing. Sintesis DNA menggunakan dNTP sebagai substrat, sedangkan sintesis RNA menggunakan NTP sebagai substrat.[2] NTP tidak dapat dikonversi langsung ke dNTP. DNA mengandung empat basa nitrogen yang berbeda: adenin, guanin, sitosin, dan timin. RNA juga mengandung adenin, guanin, dan sitosin, tetapi menggantikan timin dengan urasil.[15] Dengan demikian, sintesis DNA membutuhkan dATP, dGTP, dCTP, dan dTTP sebagai substrat, sedangkan sintesis RNA membutuhkan ATP, GTP, CTP, dan UTP.

 

Sintesis asam nukleat dikatalisis oleh DNA polimerase atau RNA polimerase masing-masing untuk sintesis DNA dan RNA.[16] Enzim-enzim ini secara kovalen menghubungkan gugus -OH bebas pada karbon 3' dari rantai nukleotida yang sedang tumbuh ke -fosfat pada karbon 5' NTP berikutnya, melepaskan gugus - dan -fosfat sebagai pirofosfat ( PPi).[17] Ini menghasilkan hubungan fosfodiester antara dua (d)NTP. Pelepasan PPi memberikan energi yang diperlukan untuk terjadinya reaksi.[17] Penting untuk dicatat bahwa sintesis asam nukleat terjadi secara eksklusif dalam arah 5 'ke 3'.

== Refrensi ==