Museum Kedaton Sultan Ternate dibangun pada [[24 November]] [[1813]] oleh [[Sultan Muhammad Ali]] dengan luas bangunan 1500 meter kuadrat di tanah seluas 1,5 hektar.<ref name="Indonesia Travel">{{cite web|url= http://www.indonesia.travel/id/destination/606/museum-kedaton-sultan-ternate| title= ''Museum Kedaton Sultan Ternate: Kejayaan Kesultanan Ternate di Indonesia Timur''| publisher= indonesia.travel| accessdate= 5 Juni 2014.22.00}}</ref> Museum ini dibangun oleh seorang [[arsitektur]] dari [[Tiongkok]].<ref name="Asosiasi Museum Indonesia">{{cite web| url= http://asosiasimuseumindonesia.org/galeri/2-single-articles/295-museum-kedaton-sultan-ternate.html| title= ''Museum Kedaton Sultan Ternate''| publisher= asosiasimuseumindonesia.org| accessdate= 5 Juni 2014.23.00}}</ref> Sejak tahun [[1981]], pengelolaan bangunan diserahkan kepada Departemen Pendidikan dan Kebudayaan, walaupun dalam kesehariannya masih digunakan sebagai kediaman sultan.<ref name="Indonesia Travel"/> Museum ini diresmikan oleh Menteri Kebudayaan pada tahun [[1982]].<ref name="Indonesia Travel"/>
