Koster lahir di kota [[Singaraja]] pada tanggal 20 Oktober 1962. Ia menyelesaikan pendidikan dua belas tahun pertamanya di sana dari tahun 1968, lulus [[SMA Negeri 1 Singaraja|SMA Negeri Singaraja]] pada tahun 1980. Setelah itu, ia pindah ke [[Bandung]] untuk belajar di [[Institut Teknologi Bandung]], dan lulus pada tahun 1987 dengan gelar sarjana matematika. Kemudian meraih gelar mastermagister manajemen dari Sekolah Tinggi Ilmu Ekonomi International Golden Institute (1995) dan gelar doktor dari [[Universitas Negeri Jakarta]] (1999).<ref name="merdeka">{{cite news |title=Wayan Koster |url=https://www.merdeka.com/wayan-koster/ |accessdate=8 September 2018 |work=merdeka.com|language=id}}</ref><ref>{{cite news |title=Alumni ITB Bali Dukung Wayan Koster Jadi Gubernur |url=https://news.okezone.com/read/2018/04/01/340/1880739/alumni-itb-bali-dukung-wayan-koster-jadi-gubernur |access-date=8 September 2018 |work=Okezone |date=1 April 2018 |language=id-ID |archive-url=https://web.archive.org/web/20180718220335/https://news.okezone.com/read/2018/04/01/340/1880739/alumni-itb-bali-dukung-wayan-koster-jadi-gubernur |archive-date=2018-07-18 |url-status=live }}</ref>
