Bangunan [[Stasiun kereta api|Stasiun]] [[Jalan Pangeran Jayakarta|Jayakarta]]stasiun ini sudah bergaya modern, dengan sentuhan panel-panel berwarna [[mawar (warna)|pink fanta]] yang sampai hari ini masih dipertahankan dan tidak pernah diubah catnya, hanya tiang peronnya saja yang diubah warnanya menjadi [[merah kesumba]].
Berbeda dengan [[Stasiun kereta api|stasiun-stasiun]] lainnya yang terletak di [[Rel|jalur KA]] layang [[Stasiun Manggarai|Manggarai]]-[[Stasiun Jakarta Kota|JakartaManggarai–Jakarta Kota]] yang mempunyai tiga lantai, [[Stasiun kereta api|stasiun]] ini hanya mempunyai dua lantai saja, alasannya adalah karenakerana [[Rel|jalurtitik KA]]letak layangstasiun ini persiapan akan turun dan menapak ke tanah serta berakhir di [[Stasiun Jakarta Kota]].
PadaMasih di area [[Stasiun kereta api|stasiun]] ini juga masih terdapat sisa 1 buah jembatan [[Kereta api|KA]] lama peninggalan dari [[Rel|jalur]][[Petak jalan|lintas]] [[Stasiun Manggarai|Manggarai]]-[[Stasiun Jakarta Kota|JakartaKota]]Manggarai–Kota saat masih menapak di tanah, sisa jembatan [[Kereta api|KA]] ini kinisekarang beralih fungsi menjadi jalan untuk warga. Sebelumnya, terdapat 2 buah jembatan, disini karena [[Rel|jalur]] [[Petak jalan|lintas]] [[Stasiun Manggarai|Manggarai]]-[[Stasiun Jakarta Kota|Jakarta Kota]] adalah [[jalur ganda]] atau ''double track.'' Namun,namun jembatan yang satunya lagi sudah dibongkar karenakerana lahannya akan dipakai untuk pembangunan pondasi [[peron]] layang [[Stasiun kereta api|stasiun]], dan hanya tinggal menyisakan 1 jembatan saja.
[[Berkas:Sisa jembatan jalur bawah Stasiun Jayakarta (arah JAKK)..jpg|jmpl|Sisa jembatan jalur bawah Stasiun Jayakarta (arah JAKK).|al=Sisa jembatan jalur bawah Stasiun Jayakarta (arah JAKK).]]
[[Berkas:Sisa jembatan jalur bawah Stasiun Jayakarta (arah MGB)..jpg|jmpl|Sisa jembatan jalur bawah Stasiun Jayakarta (arah MGB).|al=Sisa jembatan jalur bawah Stasiun Jayakarta (arah MGB).]]
[[Stasiun kereta api|Stasiun]] [[Jalan Pangeran Jayakarta|Jayakarta]] mempunyai dua [[Rel|jalur]]. Pada tahun 2019-20202019–2020, dipasang sebuah [[wesel]][[persimpangan]] baru yang berlokasi sekitar 50-7050–70 meter ke arah [[selatan]] dari [[Stasiunstasiun kereta api|Stasiun]] [[Jalan Pangeran Jayakarta|Jayakarta]]ini, serta juga dilakukan modifikasi [[listrik aliran atas]] (LAA) untuk [[Rel|jalur]] pada pada [[wesel]] ini.{{Tata letak peron KAI Commuter
