Setelah perilisan ''Resident Evil 3: Nemesis,'' Capcom Production Studio 4 baru didirikan di Jepang dengan Shinji Mikami menjabat sebagai manajer umum studio dan bekerja sebagai produser eksekutif untuk menangani berbagai permaian video termasuk ''[[Devil May Cry (permainan video)|Devil May Cry]]''. Kemudian pada tahun 2000 Mikami terlibat dalam proyek permainan video ''[[Resident Evil – Code: Veronica]]'' yang dirancang khusus untuk [[konsol permainan]] [[Dreamcast]]. Pada perilisan permainan video tersebut SHinji Mikami berhasil menjual sebanyak 1,14 juta unit, dan di tahun yang sama ia juga merilis ''Dino Crisis 2'' dengan hasil penjualan mencapai 1,19 juta unit di seluruh dunia.<ref>{{Cite web|date=5 Mei 2009|title=CAPCOM {{!}} Platinum Titles|url=http://ir.capcom.co.jp/english/business/million.html|website=web.archive.org|access-date=2021-12-18|archive-date=2009-05-05|archive-url=https://web.archive.org/web/20090505174010/http://ir.capcom.co.jp/english/business/million.html|dead-url=unfit}}</ref> Pada 12 November 2002, ''[[Resident Evil Zero]]'' dirilis dan hasil penjualannya mencapai 138.855 unit di hari pertama peluncurannya. Pada tahun 2005, Shinji Mikami membawa permainan video ''[[Resident Evil 4]]'' menuju perilisannya dan berhasil menjual sebanyak 1,25 juta unit di seluruh dunia.<ref>{{Cite web|last=Wilson|first=Andrew|date=1 November 2004|title=Capcom Adds Resident Evil 4 to PlayStation 2 Line-Up|url=https://www.gamedeveloper.com/pc/capcom-adds-i-resident-evil-4-i-to-playstation-2-line-up|website=Game Developer|language=en|access-date=2021-12-18}}</ref> Setelah kesuksesan ''Resident Evil 4'', Ia meninggalkan Studio 4 dan mendirikan [[Clover Studio]] pada Juli 2004. Ia bergabung bersama [[Atsushi Inaba]] (produser ''Steel Battalion'' dan ''Viewtiful Joe'') dan [[Hideki Kamiya]] (sutradara ''Devil May Cry'') dalam pengerjaan permainan video ''[[God Hand|God hand]]'' yang memparodikan [[budaya populer]] Amerika dan Jepang.
