Helicobacter pylori: Perbedaan antara revisi

'''''Helicobacter pylori''''', yang sebelumnya disebut '''''Campylobacter pylori''''', adalah sebuah [[bakteri]] [[mikroaerofil]] [[Gram-negatif]] yang biasanya ditemukan di [[lambung]]. Bakteri tersebut diidentifikasikan pada 1982 oleh ilmuwan Australia [[Barry Marshall]] dan [[Robin Warren]] yang menemukan bahwa bakteri itu hadir pada orang dengan [[gastritis]] dan [[ulkus peptikum]] kronis, kondisi yang sebelumnya tidak diyakini memiliki penyebab [[Mikroorganisme|mikrob]]. ''H. pylori'' juga terkait dengan perkembangan ulkus [[duodenum]] dan [[kanker lambung]]. Namun, lebih dari 80% dari individu yang terinfeksi dengan bakteri tidak menunjukkan gejala, dan mungkin memainkan peran penting dalam ekologi perut alami.<ref>{{cite journal | author = Blaser MJ | title = Who are we? Indigenous microbes and the ecology of human diseases | journal = EMBO Reports | volume = 7 | issue = 10 | pages = 956–60 | year = 2006 | pmid = 17016449 | pmc = 1618379 | doi = 10.1038/sj.embor.7400812 | url = http://www.nature.com/embor/journal/v7/n10/pdf/7400812.pdf | access-date = 2016-04-29 | archive-date = 2012-11-05 | archive-url = https://web.archive.org/web/20121105233214/http://www.nature.com/embor/journal/v7/n10/pdf/7400812.pdf | dead-url = no }}</ref>

Lebih dari 50% dari populasi dunia memiliki ''H. pylori'' di [[saluran pencernaan]] bagian atas mereka. Infeksi ini lebih umum di negara-negara berkembang, dan kejadian menurun di negara-negara Barat. Bentuk heliks ''H. pylori'' ini (dari hal itu nama genus berasal) diperkirakan telah berevolusi untuk menembus lapisan [[mukus|bermukus]] perut.<ref name= YamaokaY>{{cite book|author=Yamaoka, Yoshio|title=''Helicobacter pylori'': Molecular Genetics and Cellular Biology|publisher=Caister Academic Pr|year=2008|isbn=1-904455-31-X}}</ref><ref name="Brown">{{cite journal | author = Brown LM | title = ''Helicobacter pylori'': epidemiology and routes of transmission | journal = Epidemiol Rev | volume = 22 | issue = 2 | pages = 283–97 | year = 2000 | pmid = 11218379 | doi = 10.1093/oxfordjournals.epirev.a018040 | url = http://epirev.oxfordjournals.org/content/22/2/283.full.pdf | access-date = 2016-04-29 | archive-date = 2016-06-15 | archive-url = https://web.archive.org/web/20160615235855/http://epirev.oxfordjournals.org/content/22/2/283.full.pdf | dead-url = no }}</ref>

Rasa sakit biasanya terjadi saat perut kosong, antara waktu makan dan di pagi hari, tapi bisa juga terjadi di lain waktu. Gejala ulkus yang kurang umum termasuk mual, muntah, dan kehilangan nafsu makan. Perdarahan juga bisa terjadi; perdarahan berkepanjangan dapat menyebabkan anemia yang menyebabkan rasa lemah dan kelelahan. Jika perdarahan berat, dapat terjadi muntah darah atau hematemesis atau buang air besar hitam (melena).<ref name="Center for Disease Control">{{cite web|title=Helicobacter pylori|url=https://www.cdc.gov/ulcer/files/hpfacts.pdf|website=cdc.gov.|publisher=Center for Disease Control|accessdate=7 October 2017|archive-date=2019-01-12|archive-url=https://web.archive.org/web/20190112203116/https://www.cdc.gov/ulcer/files/hpfacts.PDF|dead-url=no}}</ref>

''H. pylori'' memiliki empat sampai enam [[flagela]] di tempat yang sama; semua spesies ''Helicobacter'' lambung dan enterohepatik sangat motil karena memiliki flagela.<ref>{{cite journal |vauthors=Josenhans C, Eaton KA, Thevenot T, Suerbaum S | title = Switching of Flagellar Motility in ''Helicobacter pylori'' by Reversible Length Variation of a Short Homopolymeric Sequence Repeat in fliP, a Gene Encoding a Basal Body Protein | journal = Infect Immun | volume = 68 | issue = 8 | pages = 4598–603 | date = August 2000 | pmid = 10899861 | pmc = 98385 | doi = 10.1128/IAI.68.8.4598-4603.2000 }}</ref> Filamen flagelar karakteristik dari ''Helicobacter'' terdiri dari dua flagelin yang dapat dikopolimerisasi, FlaA dan FlaB.<ref name= Rustetal>{{cite book|isbn=1-904455-31-X|chapterurl=http://www.horizonpress.com/hpl2|vauthors=Rust M, Schweinitzer T, Josenhans C |year=2008|chapter=Helicobacter Flagella, Motility and Chemotaxis|title=''Helicobacter pylori'': Molecular Genetics and Cellular Biology|editor=Yamaoka Y|publisher=Caister Academic Press|access-date=2017-07-19|archive-date=2016-08-18|archive-url=https://web.archive.org/web/20160818123135/http://www.horizonpress.com/hpl2|dead-url=no}}</ref>

H. pylori terdiri dari strain-strain yang beragam, dan ratusan [[genom]] telah sepenuhnya [[Pengurutan DNA|disekuensing]].<ref name="Tomb 1997">{{cite journal |vauthors=Tomb JF, White O, Kerlavage AR, Clayton RA, Sutton GG, Fleischmann RD, Ketchum KA, Klenk HP, Gill S, Dougherty BA, Nelson K, Quackenbush J, Zhou L, Kirkness EF, Peterson S, Loftus B, Richardson D, Dodson R, Khalak HG, Glodek A, McKenney K, Fitzegerald LM, Lee N, Adams MD, Hickey EK, Berg DE, Gocayne JD, Utterback TR, Peterson JD, Kelley JM, Cotton MD, Weidman JM, Fujii C, Bowman C, Watthey L, Wallin E, Hayes WS, Borodovsky M, Karp PD, Smith HO, Fraser CM, Venter JC | title = The complete genome sequence of the gastric pathogen ''Helicobacter pylori'' | journal = Nature | volume = 388 | issue = 6642 | pages = 539–47 | date = August 1997 | pmid = 9252185 | doi = 10.1038/41483 }}</ref><ref>{{cite web|url=http://genolist.pasteur.fr/PyloriGene|title= Genome information for the ''H. pylori'' 26695 and J99 strains|publisher=Institut Pasteur|year=2002|format=|work=|accessdate=1 September 2008|archive-date=2017-11-26|archive-url=https://web.archive.org/web/20171126221437/http://genolist.pasteur.fr/PyloriGene/|dead-url=no}}</ref><ref name="genome26695">{{cite web|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=genome&cmd=Retrieve&dopt=Overview&list_uids=128|title=''Helicobacter pylori'' 26695, complete genome|publisher=National Center for Biotechnology Information|format=|work=|accessdate=1 September 2008}}</ref><ref>{{cite web|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=genome&cmd=Retrieve&dopt=Overview&list_uids=139|title=''Helicobacter pylori'' J99, complete genome|publisher=National Center for Biotechnology Information|format=|work=|accessdate=1 September 2008|archive-date=2011-04-06|archive-url=https://web.archive.org/web/20110406134345/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=genome|dead-url=no}}</ref><ref name="pmid16788065">{{cite journal |vauthors=Oh JD, Kling-Bäckhed H, Giannakis M, Xu J, Fulton RS, Fulton LA, Cordum HS, Wang C, Elliott G, Edwards J, Mardis ER, Engstrand LG, Gordon JI | title = The complete genome sequence of a chronic atrophic gastritis ''Helicobacter pylori'' strain: Evolution during disease progression | journal = Proc Natl Acad Sci USA | volume = 103 | issue = 26 | pages = 9999–10004 | date = June 2006 | pmid = 16788065 | pmc = 1480403 | doi = 10.1073/pnas.0603784103 | bibcode = 2006PNAS..103.9999O }}</ref><ref>{{Cite journal|last=Vliet|first=Van|last2=M|first2=Arnoud H.|date=1 January 2017|title=Use of pan-genome analysis for the identification of lineage-specific genes of Helicobacter pylori|url=https://academic.oup.com/femsle/article-abstract/364/2/fnw296/2735779/Use-of-pan-genome-analysis-for-the-identification|journal=FEMS Microbiology Letters|volume=364|issue=2|doi=10.1093/femsle/fnw296|issn=0378-1097|access-date=2018-10-08|archive-date=2023-08-17|archive-url=https://web.archive.org/web/20230817213324/https://academic.oup.com/femsle/article/364/2/fnw296/2735779|dead-url=no}}</ref> Genom strain "26695" terdiri dari sekitar 1,7 juta [[pasangan basa]], dengan sekitar 1.576 gen. Pan-genom, yang merupakan gabungan dari 30 strain yang sudah diurutkan, mengkodekan 2.239 famili protein (kelompok ortolog atau ''orthologous groups'', OG). Di antara mereka, 1248 OG dilestarikan di semua 30 strain, dan mewakili ''inti universal''. 991 OG yang tersisa adalah ''genom aksesori'' di mana 277 OG adalah unik (yaitu, OG ada hanya dalam satu strain).<ref>{{Cite journal|last=Uchiyama|first=Ikuo|last2=Albritton|first2=Jacob|last3=Fukuyo|first3=Masaki|last4=Kojima|first4=Kenji K.|last5=Yahara|first5=Koji|last6=Kobayashi|first6=Ichizo|date=9 August 2016|title=A Novel Approach to Helicobacter pylori Pan-Genome Analysis for Identification of Genomic Islands|url=http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0159419|journal=PLOS ONE|volume=11|issue=8|pages=e0159419|doi=10.1371/journal.pone.0159419|issn=1932-6203|pmc=4978471|pmid=27504980|bibcode=2016PLoSO..1159419U|access-date=2018-10-08|archive-date=2022-12-23|archive-url=https://web.archive.org/web/20221223184436/https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0159419|dead-url=no}}</ref>

[[Virulensi]] patogenik lambung manusia ''H. pylori'' bergantung pada [[nikel]], yaitu sebagai [[Kofaktor (biokimia)|kofaktor]] dari dua enzim penting bernama urease and [NiFe] [[Hidrogenase|hydrogenase]]. Nikel berperan dalam mengaktifkan apo-urease (urease yang belum aktif) menjadi holo-urease (urease yang telah aktif). Hal ini berkat bantuan protein pengikat nikel ''(nickel-binding protein).'' Dua protein pengikat nikel paralogus kecil dengan kandungan tinggi dalam ''[[Histidina|Histidine]]'' (Hpn dan Hpn-2) memainkan peran sentral dalam mempertahankan kandungan nikel intraseluler yang tidak beracun dan dalam mengendalikan transportasi intraselulernya. Hpn dan Hpn-2 berperan penting dalam kolonisasi ''H. pylori'' pada inang.<ref name=":0">{{Cite journal|last=Vinella|first=Daniel|last2=Fischer|first2=Frédéric|last3=Vorontsov|first3=Egor|last4=Gallaud|first4=Julien|last5=Malosse|first5=Christian|last6=Michel|first6=Valérie|last7=Cavazza|first7=Christine|last8=Robbe-Saule|first8=Marie|last9=Richaud|first9=Pierre|date=7 Des 2015|title=Evolution of Helicobacter: Acquisition by Gastric Species of Two Histidine-Rich Proteins Essential for Colonization|url=https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1005312|journal=PLOS Pathogens|language=en|volume=11|issue=12|pages=e1005312|doi=10.1371/journal.ppat.1005312|issn=1553-7374|pmc=PMC4671568|pmid=26641249|access-date=2022-12-16|archive-date=2022-12-26|archive-url=https://web.archive.org/web/20221226013000/http://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1005312|dead-url=no}}</ref>

Pada saat ''H. pylori'' menginfeksi [[sel epitel]] pada lambung, [[sistem imun bawaan]] pada inang merespon infeksi tersebut dengan menghasilkan spesies oksigen reaktif (''[[:en:Reactive oxygen species|reactive oxigen species]],'' ROS), salah satunya adalah asam hidroklorous ([[:en:Hypochlorous acid|hypochlorous acid]], HOCl). Uji ketahanan ''H. pylori'' dengan perlakuan pemberian HOCI dapat digunakan untuk menentukan kemampuannya dalam menurunkan tingkat [[:en:Oxidative stress|oksidatif]] dan bertahan hidup. Hasilnya menunjukkan bahwa ''H. pylori'' tahan atau bersifat resisten terhadap HOCI tersebut. Sama halnya pada ''H. pylori'' stain mutan yang telah dinonaktifkan gen ureasenya pun ternyata tetap bersifat resisten terhadap HOCI. Ini menunjukkan bahwa keberadaan urease, terlepas dari aktivitas katalitiknya, dapat berperan dalam mencegah kematian sel akibat kerusakan oksidatif. Maka dapat disimpulkan bahwa ''H. pylori'' mampu meregulasi respon imun inang.<ref>{{Cite journal|last=Schmalstig|first=Alan A.|last2=Benoit|first2=Stéphane L.|last3=Misra|first3=Sandeep K.|last4=Sharp|first4=Joshua S.|last5=Maier|first5=Robert J.|date=2018-09|editor-last=Mullineaux|editor-first=Conrad W.|title=Noncatalytic Antioxidant Role for Helicobacter pylori Urease|url=https://journals.asm.org/doi/10.1128/JB.00124-18|journal=Journal of Bacteriology|language=en|volume=200|issue=17|doi=10.1128/JB.00124-18|issn=0021-9193|pmc=PMC6088170|pmid=29866802|access-date=2022-12-16|archive-date=2022-12-16|archive-url=https://web.archive.org/web/20221216081555/https://journals.asm.org/doi/10.1128/JB.00124-18|dead-url=no}}</ref>

* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmedhealth/PMH0015937/ Information on tests for ''H. pylori''] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20130613122121/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmedhealth/PMH0015937/ |date=2013-06-13 }} from the [[National Institutes of Health]]

* [http://www.helicobacter.org European Helicobacter Study Group (EHSG)] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20080228163719/http://www.helicobacter.org/content/publications/publications.htm |date=2008-02-28 }}