Perusahaan ini memulai sejarahnya pada tahun 1993 saat PT [[Macroprima Panganutama]] didirikan untuk memproduksi olahan daging. Pada tahun 1999, PT Macroprima Panganutama meluncurkan produk [[sosis]] dengan merek "Kanzler". Pada tahun 2004, perusahaan ini resmi didirikan untuk memproduksi olahan [[susu]]. PT [[Macrosentra Niagaboga]] kemudian juga didirikan untuk mendistribusikan produk PT Macroprima Panganutama. Pada tahun 2005, perusahaan ini mulai menjalin kemitraan dengan sejumlah [[koperasi susu]] di sekitaran [[Cisarua, Bogor]], dan setahun kemudian, perusahaan ini mulai memproduksi susu pasteurisasi. PT [[Java Egg Specialities]] lalu juga didirikan untuk berbisnis di bidang produksi telur cair dan pelengkap makanan berbasis telur. Pada tahun 2007, perusahaan ini meluncurkan produk [[yogurt]] dan mulai menjual produk susunya melalui toko modern. PT Macrosentra Niagaboga kemudian juga mulai beroperasi sebagai agen dan distributor [[rantai dingin]]. Pada tahun 2011, perusahaan ini mulai mengoperasikan pabrik pengolahan susu baru di [[Sentul]], Bogor.
Pada tahun 2012, PT Macroprima Panganutama membentuk sebuah [[perusahaan patungan]] bersama [[Kanematsu Corporation]] asal [[Jepang]], PT Java Egg Specialities yang kemudian juga meluncurkan produk mayones dengan merek "Euro Gourmet". Pada tahun 2013, perusahaan ini meluncurkan [[Miss Cimory]] untuk dapat mendistribusikan produknya dari rumah ke rumah, dan setahun kemudian, perusahaan ini juga mulai mendistribusikan produknya melalui jalur perdagangan umum. Pada tahun 2015, PT Macroprima Panganutama meluncurkan produk sosis bakar dengan merek "Besto". [[Restrukturisasi]] kemudian juga dilakukan, sehingga perusahaan ini resmi menjadi [[perusahaan induk|induk]] bagi PT Macrosentra Niagaboga, PT Macroprima Panganutama, dan PT Java Egg Specialities. Pada tahun 2017, perusahaan ini mulai mengekspor produknya ke [[Tiongkok]] dan [[Vietnam]]. Perusahaan ini juga meluncurkan produk sosis dengan merek "Juragan" yang ditujukan untuk dijual melalui [[pedagang kaki lima]]. Setahun kemudian, perusahaan ini mulai mengoperasikan pusat distribusi baru di [[Sentul]], Bogor. Pada tahun 2019, PT Macroprima Panganutama mulai mengoperasikan pabrik baru di Semarang dan meluncurkan produk nugget ayam, sementara PT Java Egg Specialities juga meluncurkan produk saus. Pada tahun 2020, perusahaan ini meluncurkan produk yogurt rendah lemak dan yogurt Yunani. Perusahaan ini kemudian juga mulai mengekspor produknya ke [[Filipina]].<ref name="annual" /> Pada tahun 2021, perusahaan ini mulai mendistribusikan produknya melalui [[Grab]]<ref name="profil">{{Cite web|url=https://cimory.com/our-history.php|title=Sejarah Perusahaan|publisher=PT Cisarua Mountain Dairy Tbk|language=id|access-date=17 Agustus 2022}}</ref> dan resmi melantai di [[Bursa Efek Indonesia]].<ref name="listing">{{Cite web|url=https://money.kompas.com/read/2021/12/06/111300626/cimory-resmi-melantai-di-bei-peroleh-dana-segar-sebesar-rp-3-66-triliun|title=Cimory Resmi Melantai di BEI, Peroleh Dana Segar Sebesar Rp 3,66 Triliun|publisher=Kompas|first=Kiki|last=Safitri|date=6 Desember 2021|language=id|access-date=17 Agustus 2022}}</ref>