SMA Negeri 3 Kota Pekalongan memiliki esktrakulikuler dalam teater untuk memfasilitasi jiwa kesenian bagi siswanya. Hingga pada tahun 2007, Teater SMA Negeri 3 Kota Pekalongan mewakili Karesidenan Pekalongan (yang meliputi [[Kabupaten Brebes]], [[Kota Tegal]], [[Kabupaten Tegal]], [[Kabupaten Pemalang]], [[Kabupaten Pekalongan]], [[Kota Pekalongan]] dan [[Kabupaten Batang]]) dalam Lomba Teater tingkat Jawa Tengah yang diadakan di Solo.
