Saat ini, Komando Armada III di pimpin oleh seorang Panglima Komando Armada (Pangkoarmada) yang berpangkat [[Laksamana Muda]]. Saat ini jabatan Pangkoarmada diduduki oleh [[Laksda]] [[TNI]] [[Hersan|Hersan, S.H., M.Si]].
'''Daftar Panglima Komando Armada Ill sejak awal pembentukannya'''
{| class="wikitable"
|'''No'''
|'''Foto'''
|'''Nama'''
|'''Awal Menjabat'''
|'''Akhir Menjabat'''
|'''Alumni'''
|'''Pangkat Terakhir'''
|-
|1.
|[[Berkas:Pangkoarmada III ING Ariawan.jpg|100px]]
|<sup>[[Laksamana Muda|Laksda]] TNI</sup><br>[[ING Ariawan|I Nyoman Gede Ariawan]]
|2018
|2020
|AAL 1986
|Laksamana Madya TNI
|-
|2.
|[[Berkas:Kaskoarmada III Dadi Hartanto.jpg|100px]]