Itō tiba di [[Stasiun Kereta Api Harbin]] pada 26 Oktober 1909 untuk pertemuan dengan [[Vladimir Kokovtsov]], perwakilan Rusia di [[Manchuria]]. Ketika ia tiba dan melanjutkansedang untuk bertemu rekan Rusia-nyaberjalan, [[An Jung-geun]], seorang [[Korea nasionalisme|nasionalis Korea]] dan [[gerakan kemerdekaan Korea|aktivis kemerdekaan]], menembakkan pistolnya enam tembakankali ke arahnyaarah Itō. Tiga dari tembakan-tembakan memukulitu Itō dimenembus dada Itō dan ia meninggal langsung meninggal setelahnya. Jenazahnya dikembalikan ke Jepang dengan kapal cruiser (penjelajah) Angkatan Laut Kekaisaran Jepang ''[[Akitsushima]]'', dan dia diberikan pemakaman kenegaraan. An Jung-geun kemudian menyebutkan "15 alasan mengapa Itō harus dibunuh" di persidangannya.
