Desa Sidogiri didirikan oleh [[Sayyid Sulaiman]], seorang [[Sayyid]] bermarga Basyaiban dari [[Cirebon]].<ref>{{Cite web|title=Sejarah|url=https://sidogiri.net/sejarah/|website=Pondok Pesantren Sidogiri|language=id|access-date=2024-01-29}}</ref> Ayahnya, Sayyid Abdurrahman bin Muhammad bin Umar BasyaibanAsyaiban al-Alawi, merantau ke [[Nusantara]] dari [[Tarim]], [[Hadramaut]], sedangkan ibu Sayyid Sulaiman, Syarifah Khadijah, adalah putri [[Kesultanan Cirebon|Sultan Cirebon]] yang nasabnya tersambung kepada [[Sunan Gunung Jati]].<ref>{{Cite web|last=humas|first=admin|date=2023-02-12|title=Pengamanan dan Monitoring giat Haul Al-Habib Abdurrohman bin Umar Baasyaibaan & Al Magfurraha Al- Hababah Syarifah Khodijah|url=https://tribratanews.pasuruan.jatim.polri.go.id/12/02/2023/pengamanan-dan-monitoring-giat-haul-al-habib-abdurrohman-bin-umar-baasyaibaan-al-magfurraha-al-hababah-syarifah-khodijah-binti-syarif-hidayatulloh-mbah-ratu-ayu-ibu-di-masjid-makam-syarifah-k/|website=Tribratanews Polres Pacitan|language=en-US|access-date=2024-01-29}}</ref> Sayyid Sulaiman mendirikan pondok pesantren di Sidogiri dengan dibantu oleh Kiai Aminullah, santri dan menantu Sayyid Sulaiman dari [[Pulau Bawean|Bawean]].<ref>{{Cite web|date=2021-09-12|title=KH. Aminullah Penerus Perjuangan Sayid Sulaiman (Bagian II)|url=https://sidogiri.net/2021/09/kh-aminullah-penerus-perjuangan-sayid-sulaiman-bagian-ii/|website=Pondok Pesantren Sidogiri|language=id|access-date=2024-01-29}}</ref>