Pengurutan Shotgun: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
Polyharmony (bicara | kontrib) Dibuat dengan menerjemahkan halaman "Shotgun sequencing" |
Polyharmony (bicara | kontrib) k Kelebihan jarak antarbaris. |
||
Baris 1:
Dalam [[Genetika|ilmu genetika]], pengurutan ''shotgun'' adalah sebuah metode untuk mengurutkan untai DNA yang acak. Nama metode ini berasal dari analogi hasil tembakan ''shotgun'' yang menyebar secara ''quasi-random''.
Metode pengurutan DNA berbasis terminasi-rantai ("Pengurutan Sanger") hanya bisa digunakan untuk untai DNA berukuran pendek sekitar 100 hingga 100 pasangan basa. Dikarenakan limitasi ukuran tadi, sekuens yang lebih panjang akan dibagi menjadi bagian-bagian yang lebih kecil agar bisa diurutkan secara terpisah, lalu hasil pengurutan bagian-bagian kecil tadi akan disatukan untuk mendapatkan sekuens keseluruhan.
Dalam metode ''shotgun, <ref name="Staden2">{{cite journal|last=Staden|first=R|date=1979|title=A strategy of DNA sequencing employing computer programs|journal=Nucleic Acids Research|volume=6|issue=70|pages=2601–10|doi=10.1093/nar/6.7.2601|pmc=327874|pmid=461197}}</ref><ref>{{cite journal|last=Anderson|first=S|date=1981|title=Shotgun DNA sequencing using cloned DNase I-generated fragments|journal=Nucleic Acids Research|volume=9|issue=13|pages=3015–27|doi=10.1093/nar/9.13.3015|pmc=327328|pmid=6269069}}</ref>'' DNA dipecah menjadi banyak segmen kecil secara acak, kemudian diurutkan menggunakan metode terminasi rantai untuk mendapatkan hasil pembacaan. Pembacaan yang tumpang tindih dari DNA target didapatkan dari perlakuan fragmentasi dan pengurutan secara berulang kali. Kemudian, program komputer akan menggunakan berbagai hasil pembacaan yang tumpah untuk menyatukan hasilnya menjadi urutan yang kontinu.''<ref name="Staden2" />''
| |||