Jalur translokasi arginina-kembar: Perbedaan antara revisi

Konten dihapus Konten ditambahkan
Polyharmony (bicara | kontrib)
kTidak ada ringkasan suntingan
Polyharmony (bicara | kontrib)
Tidak ada ringkasan suntingan
Baris 6:
 
== Persinyalan ==
Nama jalur Tat merujuk kepada motif arginina-kembar yang sangat terkonservasi (S/TRRXFLK). Motif ini ditemukan di ujung-N dari [[peptida sinyal]] [[protein]] penumpang yang bersangkutan.<ref name="Chaddock19952">{{cite journal|author=Chaddock, A.M.|author2=Mant, A.|author3=Karnauchov, I.|author4=Brink, S.|author5=Herrmann, R.G.|author6=Klösgen, R.B.|author7=Robinson, C.|year=1995|title=A new type of signal peptide: central role of a twin-arginine motif in transfer signals for the delta pH-dependent thylakoidal protein translocase.|journal=EMBO J.|volume=14|issue=12|pages=2715–2722|doi=10.1002/j.1460-2075.1995.tb07272.x|pmc=398390|pmid=7796800}}</ref> Peptida sinyal akan dibuang dengan sinyal peptidase sinyal setelah pelepasan protein yang hendak ditranspor dari kompleks Tat.<ref name="Frielingsdorf2007">{{cite journal|author=Frielingsdorf, S.|author2=Klösgen, R.B.|year=2007|title=Prerequisites for Terminal Processing of Thylakoidal Tat Substrates|journal=J. Biol. Chem.|volume=282|issue=33|pages=24455–24462|doi=10.1074/jbc.M702630200|pmid=17581816|doi-access=free}}</ref> Setidaknya ada dua [[molekul]] TatC yang eksis berdampingan dengan tiap translokator Tat.<ref name="pmid9649434">{{cite journal|year=1998|title=Overlapping functions of components of a bacterial Sec-independent protein export pathway|journal=EMBO Journal|volume=17|issue=13|pages=3640–50|doi=10.1093/emboj/17.13.3640|pmc=1170700|pmid=9649434|vauthors=Sargent F, Bogsch EG, Stanley NR, Wexler M, Robinson C, Berks BC, [[Tracy Palmer|Palmer T]]}}</ref><ref name="pmid12163163">{{cite journal|date=August 2002|title=Topology determination and functional analysis of the Escherichia coli TatC protein|journal=FEBS Lett.|volume=525|issue=1–3|pages=65–70|doi=10.1016/s0014-5793(02)03069-7|pmid=12163163|vauthors=Gouffi K, Santini CL, Wu LF|doi-access=}}</ref> Banyak studi yang menemukan bahwa arginina-kembar memiliki peran yang krusial terhadap fungsi peptida sinyal, sementara mutasi di residu motif lain tidak terlalu berdampak pada transpor protein.<ref>{{Cite journal|last=Pickering|first=Brad S.|last2=Oresnik|first2=Ivan J.|date=2010-10|title=The Twin Arginine Transport System Appears To Be Essential for Viability in
<i>Sinorhizobium meliloti</i>|url=http://dx.doi.org/10.1128/jb.00206-10|journal=Journal of Bacteriology|volume=192|issue=19|pages=5173–5180|doi=10.1128/jb.00206-10|issn=0021-9193}}</ref> Namun, perlu diingat bahwa motif arginina-kembar juga terdapat pada sekuens yang ditujukan untuk ditranspor melalui jalur Sec.<ref name=":0">{{Cite journal|last=Palmer|first=Tracy|last2=Berks|first2=Ben C.|date=2012-06-11|title=The twin-arginine translocation (Tat) protein export pathway|url=http://dx.doi.org/10.1038/nrmicro2814|journal=Nature Reviews Microbiology|volume=10|issue=7|pages=483–496|doi=10.1038/nrmicro2814|issn=1740-1526}}</ref> Peptida sinyal untuk jalur Tat umumnya lebih hidrofilik pada daerah h dibandingkan peptida sinyal yang ditujukan untuk jalur Sec. Bahkan, peningkatan hidrofobisitas pada daerah tersebut dapat menyebabkan sekuens diarahkan ke jalur Sec.<ref name=":1">{{Cite journal|last=Cristobal|first=S.|date=1999-06-01|title=Competition between Sec- and TAT-dependent protein translocation in Escherichia coli|url=http://dx.doi.org/10.1093/emboj/18.11.2982|journal=The EMBO Journal|volume=18|issue=11|pages=2982–2990|doi=10.1093/emboj/18.11.2982|issn=1460-2075}}</ref> Daerah c dari peptida sinyal arginina-kembar juga mengandung asam amino basa. Keberadaan asam amino basa memang bukan syarat pengenalan mekanisme Tat, tetapi sejumlah eksperimen menunjukkan keberadaan asam amino basa menghasilkan keenganan interaksi dengan jalur Sec.<ref name=":1" /><ref>{{Cite journal|last=Blaudeck|first=Natascha|last2=Kreutzenbeck|first2=Peter|last3=Freudl|first3=Roland|last4=Sprenger|first4=Georg A.|date=2003-05|title=Genetic Analysis of Pathway Specificity during Posttranslational Protein Translocation across the
<i>Escherichia coli</i>