jadwal KA ditiadakan secara terhormat, lihat diskusi di Pembicaraan Wikipedia:ProyekWIki Perkeretaapian (sebenarnya diskusi ini sdh sejak Gapeka 2021) dan mulai diimplementasikan pada 2021 akhir - 2022 awal.
Jarak tempuh dari/menuju Bandara YIA ke pusat kota Yogyakarta dapat dipersingkat dari sebelumnya 1,5 jam dengan moda darat lain menjadi hanya 40 menit dengan menggunakan kereta api bandara. Pada Mei 2023 diluncurkan layanan ekspres yang mempersingkat waktu hingga tinggal 35 menit saja. Sangat perlu dihindari perjalanan yang waktu on time , harus ada waktu space.
Kereta api bandara reguler berhenti di 3 stasiun yaitu Stasiun Yogyakarta (Tugu), [[Stasiun Wates]] (Kulon Progo) dan [[Stasiun Yogyakarta International Airport|Stasiun Kereta Bandara Yogyakarta]]. Sementara kereta api bandara ekspres tidak berhenti di Stasiun Wates. Stasiun Bandara YIA dapat dicapai dengan berjalan kaki karena terhubung langsung dengan terminal bandara. Tiket bisa dibeli pada ''vending machine'' di stasiun dan situs reservation.railink.co.id dengan mencetak kode booking. Pembayaran hanya bisa dilakukan secara non tunai (''cashless'') <ref>{{Cite web|title=Railink Corporate Web|url=https://www.railink.co.id/schedule|website=Railink Corporate Web|language=id|access-date=2023-07-01}}</ref>.
{| class="wikitable"
|+'''Tarif KA Bandara YIA'''
! colspan="3" |Rute
!Reguler
!Ekspres
|-
|YIA
|←→
|Yogyakarta
|Rp20.000
|Rp50.000
|-
|YIA
|←→
|Wates
|Rp20.000
| -
|-
|Yogyakarta
|←→
|Wates
|Rp10.000
| -
|}
Berikut jadwal KA Bandara YIA sesuai [[Grafik perjalanan kereta api|Grafik Perjalanan Kereta Api]] Tahun 2023:
{| class="wikitable"
|+'''Jadwal KA Bandara YIA (Yogyakarta → YIA)'''
!Yogyakarta (Keberangkatan) →
!Wates (Keberangkatan) →
!Yogyakarta International Airport (Kedatangan)
!Keterangan
|-
| align="center" |4:20
| align="center" |4:46
| align="center" |4:59
|
|-
| align="center" |4:50
| align="center" |5:16
| align="center" |6.39
|
|-
| align="center" |5:35
| align="center" | -
| align="center" |6:10
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |6:00
| align="center" |6:26
| align="center" |6:39
|
|-
| align="center" |6:30
| align="center" |6:56
| align="center" |7:09
|
|-
| align="center" |7:45
| align="center" |8:11
| align="center" |8:24
|
|-
| align="center" |8:30
| align="center" | -
| align="center" |9:05
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |9:30
| align="center" |9:56
| align="center" |10:09
|
|-
| align="center" |10:00
| align="center" | -
| align="center" |10:35
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |10:55
| align="center" |11:21
| align="center" |11:34
|
|-
| align="center" |12:25
| align="center" |12:51
| align="center" |13:04
|
|-
| align="center" |13:40
| align="center" | -
| align="center" |14:15
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |14:16
| align="center" |14:42
| align="center" |14:55
|
|-
| align="center" |14:54
| align="center" |15:20
| align="center" |15:33
|
|-
| align="center" |15:33
| align="center" | -
| align="center" |16:08
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |16:05
| align="center" |16:31
| align="center" |16:44
|
|-
| align="center" |16:52
| align="center" |17:18
| align="center" |17:31
|
|-
| align="center" |17:43
| align="center" |-
| align="center" |18:18
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |18:30
| align="center" |18:56
| align="center" |19:09
|
|-
| align="center" |19:17
| align="center" |19:43
| align="center" |19:56
|
|-
| align="center" |20:35
| align="center" |21:01
| align="center" |21:14
|
|}
{| class="wikitable"
|+'''Jadwal Kereta Bandara YIA (YIA → Yogyakarta)'''
!Yogyakarta International Airport (Keberangkatan) →
!Wates (Keberangkatan) →
!Yogyakarta (Kedatangan)
!Keterangan
|-
| align="center" |5:08
| align="center" |5:23
| align="center" |5:47
|
|-
| align="center" |5:42
| align="center" |5:57
| align="center" |6:21
|
|-
| align="center" |6:50
| align="center" |7:05
| align="center" |7:29
|
|-
| align="center" |7:20
| align="center" | -
| align="center" |7:55
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |7:54
| align="center" |8:09
| align="center" |8:33
|
|-
| align="center" |8:38
| align="center" |8:53
| align="center" |9:17
|
|-
| align="center" |9:15
| align="center" | -
| align="center" |9:50
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |10:25
| align="center" |10:40
| align="center" |11:04
|
|-
| align="center" |11:25
| align="center" | -
| align="center" |12:00
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |12:30
| align="center" |12:45
| align="center" |13:09
|
|-
| align="center" |13:28
| align="center" |13:43
| align="center" |14:07
|
|-
| align="center" |14:35
| align="center" | -
| align="center" |15:10
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |15:15
| align="center" |15:30
| align="center" |15:54
|
|-
| align="center" |16:05
| align="center" |16:20
| align="center" |16:44
|
|-
| align="center" |16:45
| align="center" |-
| align="center" |17:20
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |17:38
| align="center" |17:53
| align="center" |18:17
|
|-
| align="center" |18:10
| align="center" |18:25
| align="center" |18:49
|
|-
| align="center" |18:45
| align="center" |-
| align="center" |19:20
|Layanan Ekspres
|-
| align="center" |19:35
| align="center" |19:50
| align="center" |20:14
|
|-
| align="center" |20:06
| align="center" |20:21
| align="center" |20:45
|
|-
| align="center" |21:25
| align="center" |21:40
| align="center" |22:04
|
|}
== Kontroversi ==
{{main|Kontroversi lokasi Bandar Udara Internasional Yogyakarta}}
