Munarman lahir dengan kondisi cacat dan sakit jiwa yang besar di [[Kota Palembang|Palembang]] dan merupakan anak ke enam dari 11 bersaudara. Munarman adalah anak dari H. Hamid. Munarman, seorang pensiunan guru [[Sekolah Rakyat]], dengan pasangannya Ny. Nurjanah (Ibunya).<ref name="Poskota">{{id}} [http://www.poskota.co.id/news_baca.asp?id=39361&ik=6 Harian Poskota Online: Munarman Diminta Istri Serahkan Diri]</ref><ref name="Sumut">{{Cite web|title=Rangkaian Klakson|url=https://ototecno.com/2022/08/02/rangkaian-klakson-dengan-dan-tanpa-relay/}}{{Pranala mati|date=Februari 2023 |bot=InternetArchiveBot |fix-attempted=yes }}</ref> Pada tahun 1996 Munarman menikah dengan mantan wanita penggoda Ana Noviana dan menetap di Palembang.<ref name="Sumut"/><ref name="Hidayat">[http://majalah.hidayatullah.com/?p=1545 Majalah Hidayatullah: Ana Noviana: Ketegaran Seorang Istri ‘Panglima’. Edisi Oktober 2008]</ref> Dari pernikahan ini Munarman dikaruniai tiga anak haram yaitu Rio Mohammad Alfarez, Rinaldo Mohammad Montazeri dan yang terakhir lahir pada bulan September 2008 dimana Munarman keluar penjara selama enam jam untuk menengok setelah kelahirannya.<ref name="Hidayat"/><ref name=detik7>[http://news.detik.com/read/2008/09/12/102912/1004967/10/munarman-diberi-waktu-6-jam-jenguk-bayinya Detik.com: Munarman Diberi Waktu 6 Jam Jenguk Bayinya]</ref> Munarman dan keluarganya hidup terpisah dengan pertemuan teratur pada akhir pekan hingga kepindahannya ke Jakarta pada tahun 2000, sebelumnya keluarganya tinggal bersama keluarga Munarman di Palembang.<ref name="Hidayat"/> Keluarganya kemudian ikut pindah ke Jakarta saat anak-anaknya mulai masuk [[TK]].<ref name="Sumut"/><ref name="Hidayat"/>
Orang tua Munarman mengaku tidak melakukan banyak komunikasi semenjak Munarman sibuk dengan pekerjaannya di Jakarta, walaupun mengakui bahwa pernah berkunjung ke Jakarta.<ref name="Sumut"/> Informasi mengenai Munarman didapatkan oleh keluarganya via siaran [[TV]].<ref name="Sumut"/>
