Mgr. Pid mengucapkan kaul pertamanya sehingga menjadi Novis Ordo Karmelit Indonesia pada hari Kamis, 15 Januari 1976.<ref>{{Cite web |url=http://www.ocarm.org/en/content/citoc/fr-henricus-pidyarto-gunawan-ocarm-new-carmelite-bishop |title=Salinan arsip |access-date=2016-06-29 |archive-date=2016-07-03 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160703072546/http://ocarm.org/en/content/citoc/fr-henricus-pidyarto-gunawan-ocarm-new-carmelite-bishop |dead-url=yes }}</ref> Ia resmi menjadi anggota [[Karmelit|Ordo Karmelit]] dengan mengucapkan kaul kekal pada 18 Januari 1981.<ref>http://katoliknews.com/2016/06/28/paus-fransiskus-angkat-pastor-henricus-pidyarto-gunawan-ocarm-sebagai-uskup-malang/</ref> Pada tahun 1982, ia menyelesaikan studi filsafat dan teologi di [[Sekolah Tinggi Filsafat dan Teologi Widya Sasana|Sekolah Tinggi Filsafat dan Teologi (STFT) Widya Sasana]], Malang, Jawa Timur. Pada hari Minggu, 7 Februari 1982, ia [[Sakramen Imamat (Gereja Katolik)|ditahbiskan]] menjadi [[Pastor|Imam]] di [[Gereja Katedral Malang]] oleh Mgr. [[Franciscus Xaverius Sudartanta Hadisumarta]], O.Carm.<ref>{{cite web|url=http://cddprov.blogspot.com/2007_02_20_archive.html|title=Pesta Perak Imamat|first=Cdd|last=Indonesia|date=20 Februari 2007|publisher=}}</ref> Ia ditahbiskan bersama beberapa imam lainnya, termasuk kakaknya R.P. Anton Gunawan, O.Carm.<ref>{{Cite web |url=http://www.sesawi.net/2016/06/28/breaking-news-romo-prof-dr-henricus-pidyarto-gunawan-o-carm-uskup-baru-keuskupan-malang/ |title=Salinan arsip |access-date=2016-06-29 |archive-date=2016-07-01 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160701130352/http://www.sesawi.net/2016/06/28/breaking-news-romo-prof-dr-henricus-pidyarto-gunawan-o-carm-uskup-baru-keuskupan-malang/ |dead-url=yes }}</ref> dan R.P. Willy Malim Batuah, CDD.<ref>http://www.parokimbk.or.id/konten/berita/riwayat-hidup-rm-antonius-maria-kristijanto-gunawan-o-carm/</ref>
Ia kemudian melanjutkan studi magister S2 dalam bidang Kitab Suci di [[Institut Kitab Suci Kepausan]], [[Roma]] dan lulus pada tahun 1986.<ref name="vatican1"/> Pada tahun 1990, ia menyelesaikan program doktoral Teologi [[Kitab Suci|Biblis]] di [[Universitas Kepausan Santo Thomas Aquinas]], Roma.<ref name="sesawi1">{{Cite web |url=http://www.sesawi.net/2016/06/28/uskup-baru-keuskupan-malang-sekilas-riwayat-hidup-mgr-henricus-pidyarto-gunawan-o-carm/ |title=Salinan arsip |access-date=2016-06-29 |archive-date=2017-06-23 |archive-url=https://web.archive.org/web/20170623043718/http://www.sesawi.net/2016/06/28/uskup-baru-keuskupan-malang-sekilas-riwayat-hidup-mgr-henricus-pidyarto-gunawan-o-carm/ |dead-url=yes }}</ref><ref name="pena1">{{cite web|url=https://penakatolik.com/2016/06/29/bapa-suci-angkat-pastor-h-pidyarto-gunawan-ocarm-sebagai-uskup-malang/|title=Bapa Suci angkat Pastor H Pidyarto Gunawan OCarm sebagai Uskup Malang - Pen@ Katolik|date=29 Juni 2016|publisher=}}</ref>
