Ali Wardhana menyelesaikan pendidikan S1 di Fakultas Ekonomi UIUniversitas Indonesia (1958). Kemudian, melanjutkan studinya ke [[Universitas California, Berkeley|University of California di Berkeley]] dan memperoleh gelar ''Master of Arts'' pada tahun 1961. Pada tahun 1962, Ali berhasil menyelesaikan pendidikan doktoralnya dan meraih gelar Ph.D juga dari [[Universitas California, Berkeley|University of California]] dengan judul disertasi ''"Monetary Policy in an Underdeveloped Economy: with Special Reference to Indonesia"''.
