!Status
|-
| colspan=2 rowspan=112 | [[JawaDaerah TimurKhusus Ibukota Jakarta]]
| {{sta|Pasar Senen}}
| [[Kota Blitar|Blitar]]
| {{rint|jakarta|blue}} {{rint|jakarta|tjk2}} {{rint|jakarta|tjk5}} {{rint|jakarta|tjk14}}<br>Stasiun ujung, terintegrasi dengan [[Commuter Line Cikarang]] dan layanan BRT [[Transjakarta]]
| {{sta|Blitar}}
| {{rint|surabaya|pd}}<br>Stasiun ujung, terintegrasi dengan {{KA|Commuter Line Dhoho dan Penataran}}
|★
|-
| {{sta|Jatinegara}}
| rowspan=2 | [[Kabupaten Tulungagung|Tulungagung]]
| {{rint|jakarta|blue}} {{rint|jakarta|tjk5}} {{rint|jakarta|tjk10}} {{rint|jakarta|tjk11}}<br>Terintegrasi dengan Commuter Line Cikarang dan layanan BRT Transjakarta
| {{sta|Ngunut}}
|▲
| rowspan=4 | {{rint|surabaya|pd}}<br>Terintegrasi dengan Commuter Line [[Kereta api Commuter Line Dhoho dan Penataran|Dhoho]]
|■
|-
| rowspan=7 | [[Jawa Barat]]
| {{sta|Tulungagung}}
| [[Kota Bekasi]]
| {{sta|Bekasi}}
| {{rint|jakarta|blue}}<br>Terintegrasi dengan Commuter Line Cikarang
|■
|-
| [[KotaKabupaten KediriBekasi|KediriBekasi]]
| {{sta|KediriCikarang}}
| {{rint|jakarta|blue}} {{rint|jakarta|lw}}<br>Terintegrasi Commuter Line Cikarang, [[Commuter Line Jatiluhur dan Walahar|Jatiluhur, dan Walahar]]
|■
|▼
|-
| rowspan=2 | [[Kabupaten NganjukKarawang|NganjukKarawang]]
| {{sta|Karawang}}
|[[Stasiun Kertosono|Kertosono]]
| rowspan=2 | {{rint|jakarta|lw}}<br>Terintegrasi dengan Commuter Line Jatiluhur dan Walahar
|■
|-
| {{sta|Cikampek}}
|[[Stasiun Nganjuk|Nganjuk]]
|
|■
|-
| rowspan=2 | [[Kabupaten MadiunIndramayu|Indramayu]]
| {{sta|CarubanHaurgeulis}}
| rowspan=5 | –
|
|■
|-
| {{sta|Jatibarang}}
|[[Kota Madiun]]
|[[Stasiun Madiun|Madiun]]
|
|■
|-
| [[Kota Cirebon]]
|[[Kabupaten Magetan|Magetan]]
| {{sta|MagetanCirebon}}
|
|■
|-
| rowspan=210 | [[KabupatenJawa Ngawi|NgawiTengah]]
| [[Kabupaten Tegal|Tegal]]
| {{Sta|Ngawi}}
| {{sta|Prupuk}}
|
|■
|-
| [[Kabupaten Brebes|Brebes]]
| {{Sta|Walikukun}}
| {{sta|Bumiayu}}
|
|■
|-
| rowspan="10" |[[Jawa Tengah]] || [[Kabupaten SragenBanyumas|SragenBanyumas]] || {{sta|Sragen}}
| {{sta|Purwokerto}}
|
| Terintegrasi dengan layanan bus [[Trans Jateng]] dan [[Teman Bus]] (Trans Banyumas)
|▼
|-
|[[Kota Surakarta|Surakarta]]||{{sta|Purwosari}}
| {{rint|yogyakarta|red}} {{rint|yogyakarta|bk}} {{rint|yogyakarta|as}} {{Rint|solo|k1s}} {{Rint|solo|k2s}}<br>Terintegrasi dengan [[bus rel Bathara Kresna]] dan [[kereta api Bandara Internasional Adisoemarmo]]. Stasiun ini juga merupakan stasiun pemberhentian [[KRL Commuter Line Yogyakarta|Commuter Line Yogyakarta]]
|■
|-
| [[Kabupaten KlatenCilacap|KlatenCilacap]]
| {{sta|KlatenKroya}}
| rowspan=3 | –
| {{rint|yogyakarta|y}} {{rint|yogyakarta|as}}<br>Terintegrasi dengan [[kereta api Bandara Internasional Adisoemarmo]]. Stasiun ini juga merupakan stasiun pemberhentian Commuter Line Yogyakarta
|■
|-
| rowspan=2 | [[Kabupaten Kebumen|Kebumen]]
|[[Kabupaten Purworejo|Purworejo]]||[[Stasiun Kutoarjo|Kutoarjo]]
| {{sta|Gombong}}
|{{rint|yogyakarta|blue}}<br>Terintegrasi dengan Commuter Line [[Prambanan Ekspres]]
|■
|-
|rowspan=2 | [[Kabupaten Kebumen{{sta|Kebumen]]}}
|[[Stasiun Kebumen|Kebumen]]
|
|■
|-
| [[Kabupaten Purworejo|Purworejo]]
|[[Stasiun Gombong|Gombong]]
| {{sta|Kutoarjo}}
|
| {{rint|yogyakarta|blue}}<br>Terintegrasi dengan [[Commuter Line Prambanan Ekspres]]
|■
|-
| [[Kabupaten CilacapKlaten|CilacapKlaten]]
| {{sta|Klaten}}
|[[Stasiun Kroya|Kroya]]
| {{rint|yogyakarta|red}} {{rint|yogyakarta|as}}<br>Terintegrasi dengan [[Commuter Line Yogyakarta]] dan [[kereta api Bandara Internasional Adisoemarmo]]
|
|■
|-
| [[Kota Surakarta]]
|[[Kabupaten Banyumas|Banyumas]]
| {{sta|Purwosari}}
|[[Stasiun Purwokerto|Purwokerto]]
| {{rint|yogyakarta|red}} {{rint|yogyakarta|as}} {{rint|yogyakarta|bk}} {{rint|yogyakarta|k1s}} {{rint|yogyakarta|k2s}}<br>Terintegrasi dengan Commuter Line Yogyakarta, kereta api Bandara Internasional Adisoemarmo, {{KA|Batara Kresna}}, dan layanan bus [[Batik Solo Trans]]
| {{rint|banyumas|k1bm}} {{rint|banyumas|k3bm}}<br>Terintegrasi dengan [[Trans Banyumas]] dan [[Trans Jateng]] di Terminal Pasar Pon
|■
|-
| [[Kabupaten TegalSragen|TegalSragen]]
| {{sta|PrupukSragen}}
| –
|
|■▲
|-
| rowspan=2 | [[Daerah Istimewa Yogyakarta]]
| [[Kabupaten Brebes|Brebes]]
| [[Kabupaten Kulon Progo|Kulon Progo]]
|[[Stasiun Bumiayu|Bumiayu]]
| {{sta|Wates}}
|
| {{rint|yogyakarta|blue}} {{rint|yogyakarta|ya}}<br>Terintegrasi dengan Commuter Line Prambanan Ekspres dan [[Lin Yogyakarta International Airport|Lin YIA]]
|■
|-
| rowspan=2 | [[Daerah Istimewa Yogyakarta]] || [[Kota Yogyakarta|Yogyakarta]]
| {{sta|Lempuyangan}}
| {{rint|yogyakarta|red}} {{rint|yogyakarta|4b}} {{rint|yogyakarta|10}}<br>Terintegrasi dengan [[KRL Commuter Line Yogyakarta|Commuter Linedan Yogyakartalayanan bus [[Trans Jogja]] Istimewa
|■
|-
| rowspan=12 | [[Jawa Timur]]
| [[Kabupaten Kulon Progo|Kulon Progo]]
| rowspan=2 | [[Kabupaten Ngawi|Ngawi]]
| {{sta|Wates}}
| {{sta|Walikukun}}
| {{rint|yogyakarta|blue}} {{rint|yogyakarta|ya}}<br>Terintegrasi dengan Commuter Line {{KA|Prambanan Ekspres}} dan [[Kereta api Bandara Internasional Yogyakarta|kereta bandara YIA]]
| rowspan=6 | –
|■
|-
| {{sta|Ngawi}}
| rowspan=7 | [[Jawa Barat]] || [[Kota Cirebon|Cirebon]] || {{sta|Cirebon}}
| ■
| ■
|-
| rowspan=2 | [[Kabupaten IndramayuMagetan|IndramayuMagetan]] || {{sta|Jatibarang}}
| {{sta|Magetan}}
|
| ■
|-
| [[Kota Madiun]]
| {{sta|Haurgeulis}}
| {{sta|Madiun}}
|
| ■
|-
| rowspan=2 | [[Kabupaten KarawangMadiun|KarawangMadiun]] || {{Sta|Cikampek}}
| {{sta|Caruban}}
| rowspan=2 | {{rint|jakarta|lw}}<br>Terintegrasi dengan {{KA|Commuter Line Walahar dan Jatiluhur}}
| ■
|-
| rowspan=2 | [[Kabupaten Nganjuk|Nganjuk]]
| {{Sta|Karawang}}
| {{sta|Nganjuk}}
| ■
|■
|-
| {{sta|Kertosono}}
| [[Kabupaten Bekasi]] || {{Sta|Cikarang}}
| {{rintrowspan=4 |jakarta|blue}} {{rint|jakartasurabaya|lwdh}}<br>Terintegrasi dengan [[KRL Commuter Line Cikarang|CommuterDhoho, Line Cikarang]]Penataran, dan {{KATumapel|Commuter Line Walahar dan Jatiluhur}}Dhoho]]
|■
| ▲
|-
| [[Kota BekasiKediri]] || {{Sta|Bekasi}}
| {{sta|Kediri}}
| {{rint|jakarta|blue}}<br>Terintegrasi dengan Commuter Line Cikarang
| ■
|-
| rowspan="2" | [[DaerahKabupaten Khusus Ibukota Jakarta]]Tulungagung||[[Jakarta TimurTulungagung]]||{{sta|Jatinegara}}
| {{sta|Tulungagung}}
| {{rint|jakarta|blue}} {{rint|jakarta|tjk5}} {{rint|jakarta|tjk5c}} {{rint|jakarta|tjk5d}} {{rint|jakarta|tjk7f}} {{rint|jakarta|tjk10}} {{rint|jakarta|tjk11}}<br>Terintegrasi dengan [[Lin Lingkar Cikarang]], bus BRT [[Transjakarta]], bus kota dan Mikrotrans, stasiun ini juga merupakan stasiun pemberhentian Commuter Line Cikarang.
|■
| ▼
|-
| [[Jakarta Pusat]] || {{sta|Pasar SenenNgunut}}
|■
| {{rint|jakarta|blue}} {{rint|jakarta|tjk2}} {{rint|jakarta|tjk2a}} {{rint|jakarta|tjk5}} {{rint|jakarta|tjk5d}} {{rint|jakarta|tjk7f}}<br>Stasiun ujung, terintegrasi dengan bus BRT [[Transjakarta]], bus kota dan Mikrotrans, stasiun ini juga merupakan stasiun pemberhentian Commuter Line Cikarang.
|-
| [[Kota Blitar]]
| {{sta|Blitar}}
| {{rint|surabaya|dh}} {{rint|surabaya|pe}}<br>Stasiun ujung, terintegrasi dengan Commuter Line Dhoho dan Penataran
|★
|}
|-
|▲
|Berhenti hanya mengarah BlitarPasar Senen (satu arah)
|-
|▼
|Berhenti hanya mengarah Pasar SenenBlitar (satu arah)
|}
|