Di wilayah Kabupaten Minahasa Tenggara, [[Iklimsuhu hutanudara hujanbervariasi tropis|beriklimtergantung pada ketinggian muka lahan, dimana semakin tinggi muka lahan, suhu udara cenderung lebih rendah. Kabupaten Minahasa Tenggara memiliki [[iklim hutan hujan tropis]] (''[[Klasifikasi iklim Koppen|Af]]'') dengan curah hujan yang cenderung tinggi hampir sepanjang tahun. Musim penghujanhujan tertinggipaling di wilayah initinggi biasanya terjadi setiap bulan dengan curah hujan lebih darimelebihi 200 mm, per bulan dansementara curah hujan terendah terjadi dipada bulan Agustus-September denganyakni curah hujan berkisar antarasekitar 120 mm per bulannyabulan. Suhu udara di wilayah pesisir Kabupaten BolaangMinahasa MongondowTenggara Selatanstabil cenderungdalam konstanrentang antara 21–2821–27°C, sedangkan untukdi wilayahdaerah perbukitan dan pegunungan suhuumumnya udara biasanyaantara kurang dari 21–2621 hingga 26°C. Tingkat kelembapanKelembapan relatif di wilayah ini pun cenderungjuga tinggi dan, berkisar antara 85–90%.{{Minahasa Tenggara weatherbox}}