Menyusul terbentuknya [[Kodam XV/Pattimura]] pada tangal [[15 Mei]] [[1999]], dalam rangka penataan kembali organisasi di jajaran [[TNI Angkatan Darat]] sesuai kebijaksanaan [[Kepala Staf Angkatan Darat]], maka berdasarkan Surat Keputusan Kasad nomor Skep: 5 / II / 2005 tanggal 7 Februari 2005 dan Surat Perintah Pangdam XVIXV/Pattimura nomor: Sprin / 1094 / VII / 2005 tangal 1 Juli 2005, tentang Pengembangan Secata menjadi Rindam XV/Pattimura. Sebagaimana idealnya Lembaga Pendidikan di Kodam, maka Kodam XV/Pattimura yang hanya memiliki Sekolah Calon Tamtama dikembangkan menjadi Resimen Induk Kodam disingkat Rindam. Secara hierarki Rindam merupakan satuan induk yang membawahi satuan-satuan pendidikan yang ada di bawahnya, sehingga kedudukan Secata tidak lagi berdiri sendiri secara langsung di bawah Kodam, tetapi melalui Rindam XV/Pattimura. Pada tanggal 2-8-2005 diresmikan oleh Pangdam XV/Pattimura [[Syarifuddin Sumah|Mayjen TNI Syarifuddin Sumah]] & melantik [[M. Nasir Majid|Kolonel Inf M. Nasir]] sebagai Danrindam XV/Pattimura di lapangan upacara Rindam XV/Pattimura sekaligus penyerahan Sempana Rindam XV/Pattimura “Tri Daya Yudha” dan penandatanganan Prasasti.<ref>{{Cite web |url=http://rindam16-ptm.mil.id/?page_id=214 |title="Sejarah Rindam XVI/Pattimura" |access-date=2016-02-09 |archive-date=2016-03-22 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160322193656/http://rindam16-ptm.mil.id/?page_id=214 |dead-url=yes }}</ref>
