Dalam usia tiga belas tahun (1939) Badudu manamatkan Sekolah Rakyat di Ampana, Sulawesi TenggaraTengah. Kemudian, ia mengikuti kursus Volksonderwijser/CVO di Luwuk, Sulawesi TenggaraTengah (1941). Tahun 1949 ia menyelesaikan pendidikan Normaal School di Tertena, Sulawesi TenggaraTengah. Ia melanjutkan sekolah di KweekschooI/SGA, Makassar, Sulawesi Selatan dan tamat pada tahun 1951. Tahun 1955 ia menyelesaikan pendidikan B.1 Bahasa Indonesia di Bandung dan menyelesaikan pendidikan S1-nya di Fakultas Sastra Universitas Padjadjaran, Bandung (1963). Tahun 1971—1973 Badudu melanjutkan pendidikan pada Postgraduate Linguistics di Leidse Rijksuniversiteit Leiden, [[Belanda]]. Tahun 1975 ia memperoleh gelar Doktor Ilmu Sastra dengan pengkhususan linguistik di [[Universitas Indonesia]], Jakarta, melalui disertasi yang berjudul Morfologi Kata Kerja Bahasa Gorontalo.
