[[Berkas:Mount Kota Kinabalu.JPG|thumb|right|250px|Gunung Kinabalu dilihat dari lereng bukit.]]
Permukaan asal Gunung Kinabalu terdiri dari batuan sedimen yang terpecah karena kikisan selama 8 hingga 12 juta tahun. kikisan yang terus menerus itu akhirnya mennyebabkan batuan beku menjadi lebih kuat.
Semua puncak tinggi di [[Bumi|dunia]] ditutupi es tebal pada [[waktu kuartenar]] atau [[zaman air batu]] yang terjadi kurang lebih satu juta tahun yang lalu termasuk Gunung Kinabalu yang ketika itu sama tingginya dengan gunung-gunung di [[Himalaya|Pegunungan Himalaya]]. Ketika itu puncak Kinabalu diselubungi es dan terjadi pencairan [[glasier]]. Pencairan glasier itu dapat dilihat di kawasan [[Pinusok Gravel]] yaitu sebuah tempat yang terletak di antara [[Kundasang]] dan [[Ranau]].
