Agama yang dianut adalah [[Kristen Protestan]], [[Islam]], [[Katolik]], [[Hindu]], [[Buddha]] dan [[agama Konghucu]]. Berdasarkan sensus penduduk tahun 1999, jumlah Muslim di Manado mencapai 2049 persen, sedangkan Kristen 8051 persen. Namun data tahun 2003 menunjukkan persentase jumlah pemeluk Islam dan Kristen sama, yakni 8050:50.<ref>http://www.republika.co.id:208080/berita/24724/ponpes-putri-assalam-tonggak-dakwah-islam-di-manado?quicktabs_24724=first</ref> Meski begitu heteroginnya, namun masyarakat Manado sangat menghargai sikap hidup toleran, rukun, terbuka dan dinamis. Karenanya kota Manado memiliki lingkungan sosial yang relatif kondusif dan dikenal sebagai salah satu kota yang relatif aman di Indonesia. Sewaktu [[Indonesia]] sedang rawan-rawannya dikarenakan goncangan politik sekitar tahun [[1999]] dan berbagai kerusuhan melanda kota-kota di Indonesia. Kota Manado dapat dikatakan relatif aman. Hal itu tercermin dari semboyan masyarakat Manado yaitu ''Torang samua basudara'' yang artinya "Kita semua bersaudara".
