Koleksi [[tumbuhan paku]] ditata di bawah pepohonan besar dan rindang, karena kelompok tumbuhan ini menyukai tempat rindang dan lembablembap. Koleksinya mencapai 60 jenis dari 36 marga dan 21 suku. Di antaranya [[paku sarang burung]] (''Asplenium nidus''), [[suplir]] (''Adiantum'' spp.), [[hata]] (''Lygodium circinnatum''), dan [[paku tanduk rusa]]/simbar menjangan (''Platycerium coronarium''). Ada beberapa koleksi tumbuhan paku bermanfaat lainnya, seperti [[paku sayur]] (''Athyrium esculentum'') yang dapat dimakan tunasnya, ''Asplenium sp.'' dan ''Adiantum sp.'' sebagai tanaman hias, [[paku ekor kuda]] ''Equisetum debile'' sebagai bahan pengobatan, ''Cyathea contaminans'' sebagai bahan media tumbuh anggrek, dan hata ''Lygodium circinnatum'' sebagai bahan kerajinan.
