Kemampuan Naruto pada awal cerita hanyalah jurus mesum tak berguna bernama ''Oiroke no Jutsu'' yang bahkan Hokage sekalipun tak bisa "menahannya". Tetapi, dia lalu bisa menggunakan kage bunhinkagebunshin no jutsu setelah mecurimencuri gulungan rahasia dari hokage. Padahal dia tidak bisa menggunakan BunhinBunshin no jutsu sekalipun dan hasilnya selalu gagal. Di akhir part 1, Naruto berhasil menggunakan jutsu-jutsu dasar dan jutsu baru bernama ''Rasengan''. Yaitu jutsu supersulit yang memutar dan memadatkan chakra dan memukulkannya ke musuh/target. Dia juga membuat variasi ''Rasengan'' yaitu ''DaikyoDaikyou Rasengan'' yang menggunakan 2 kagebunshin untuk menembakkan jutsu tersebut ke tubuh target. Naruto juga bisa menggunakan ''Kuchiyose'' dengan Katak. Dia juga mengembangkan taijutsu miliknya sendiri yaitu ''Naruto Uzumaki NisinrendanNishin rendan no maki'' atau "gulungan amukan 100 uzumaki naruto" yang menggunakan teknik kagebunshin. Di cerita sekarang, Naruto diajarkan untuk memanipulasi chakra angin miliknya untuk menyempurnakan jutsu andalannya, ''Rasengan''. Akhirnya, di chapter 337 naruto berhasil menyempurnakan rasengannya dan menyelamatkan tim kakashi dari marabahaya.
