Koyama lahir di [[Tokyo]] pada tahun 1929 <ref name="Morse">{{en}} Merrill Morse. ''Kosuke'' ''Koyama:'' ''A'' ''Model'' ''for'' ''Intercultural'' ''Theology''. Frankfurt: Peter Lang.</ref>. Kemudian, ia pindah ke [[New Jersey]] di, [[Amerika Serikat]] (1954), di mana ia menyelesaikan gelar Ph.D. di Princeton Theological Seminary pada tahun 1959 <ref name="Morse"></ref>. Setelah mengajar di seminari teologi di [[Thailand]] (1960-1968), ia diangkat menjadi direktur eksekutif Asosiasi Sekolah-Sekolah Teologi di Asia Tenggara yang berlokasi di [[Singapura]] (1968-1974) <ref name="Morse"></ref>. Koyama juga pernah menjadi editor dalam Jurnal Teologi Asia Tenggara, dan Dekan Sekolah Teologi Pascasarjana Asia Tenggara <ref name="Morse"></ref>. Setelah itu ia bekerja sebagai dosen senior studi agama di University of Otago di Dunedin, [[Selandia Baru]] pada tahun 1974-1979 <ref name="Morse"></ref>. Mulai tahun 1980 Koyama bekerja di Union Theological Seminary di [[New York]] sampai pensiun pada tahun 1996 <ref name="Morse"></ref>. Untuk teman dekat dan keluarganya, ia dikenal dengan sebutan "Ko". Bersama dengan Toyohiko Kagawa (1888-1960), Kanzo Uchimura (1861-1930), dan Kazoh Kitamori (1916-1998), mereka dianggap sebagai tokoh dan teolog [[Jepang]] yang terkemuka pada abad kedua puluh <ref name="Morse"></ref>. Koyama meninggal di sebuah Rumah Sakit di [[Springfield]], karena kanker ''Oesophagal'', pada tanggal 25 Maret 2009 <ref name="Morse"></ref>. Ia meninggalkan seorang istri, bernmama Lois, dua orang anak (putra dan putri) dan lima orang cucu <ref name="Morse"></ref>.
