Sampai saat ini ada 11 [[fakultas]] di Undip, yaitu Fakultas Hukum, Fakultas Ekonomi, Fakultas Teknik, Fakultas Kedokteran, Fakultas Peternakan, Fakultas Sastra, Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan serta Fakultas Psikologi.
Universitas Diponegoro disenaraikan sebagai 100 Universitas terbaik di Asia{{fact}} ini sejak tahun 1980-an, dan menjalin kerjasama dengan 12 Universitas di [[Malaysia]].
Universitas Diponegoro disenaraikan sebagai 100 Universitas terbaik di Asia{{fact}} ini sejak tahun 1980-an, dan menjalin kerjasama dengan 12 Universitas di [[Malaysia]]. Pada bulan Ogos 2009, Rektor Universiti Susilo Wibowo menyatakan bahawa Universiti Diponegoro Semarang sudah berhenti menerima pelajar Malaysia bagi tahun akademik 2009-10. <ref>[http://thejakartaglobe.com/national/malaysians-unwelcome-at-local-university/326074 Malaysians Unwelcome At Local University]</ref>, <ref>[http://webeng.undip.ac.id/index.php/2009082749/Latest-News/undip-no-longer-admits-students-from-malaysia.html Undip No longer Admits Students from Malaysia.]</ref> Hal itu turut mendapat perhatian penerbitan ''University World News'' edisi '''Global'''. <ref>[http://www.universityworldnews.com/article.php?story=20091023104527254 INDONESIA: Discrimination against foreign students]</ref>. Hal ini diputus walaupun pegawai pendidikan pemerintah menggesa ia dibatalkan dengan mendakwa"Kami tahu akibatnya.<ref>[http://www.thejakartaglobe.com/archive/university-insists-on-malaysian-ban/326518/?doing_wp_cron=1396379107.5215849876403808593750 University Insists on Malaysian Ban. “Never waver in a decision once it’s made. We know the consequences,” Agus said.]</ref> Kementerian Pendidikan Malaysia tidak lama kemudian mengeluarkan Undip dari daftar universitas yang diiktiraf untuk para mahasiswa kedokterannya karena universitas tersebut dianggap gagal memenuhi persyaratan dari Malaysia Medical Council (MMC).<ref>[http://us.nasional.news.viva.co.id/news/read/87834-gantian_malaysia_keluarkan_undip_dari_daftar Malaysia Balas Singkirkan Undip.]</ref>
[[Universitas Andalas]] (Unand) Sumatera Barat menyatakan ia tidak menurut tindakan Universiti Diponegoro tersebut.<ref>[http://nasional.inilah.com/read/detail/148589/mahasiswa-malaysia-tak-ditolak-di-padang#.UzsTU_mSzUI Mahasiswa Malaysia Tak Ditolak di Padang]</ref>
