Vagina berasal dari pengembangan [[duktus Muller]] pada embrio.[6]<ref>{{cite journal| author=Cai Y| title=Revisiting old vaginal topics: conversion of the Müllerian vagina and origin of the "sinus" vagina.|journal=Int J Dev Biol 2009; 53:925-34| pmid=19598112| doi=10.1387/ijdb.082846yc| volume=53| issue=7| year=2009| pages=925–34}}</ref> Vagina manusia merupakan suatu saluran otot elastis yang memanjang dari [[leher rahim]] sampai ke [[vulva]].[<ref name="Snell">{{cite book|last=Snell|first=Richard S.|title=Clinical Anatomy: An Illustrated Review with Questions and Explanations|url=http://books.google.com/books?id=5s7jDVQkCfoC&pg=PA98|accessdate=19 February 2014|year=2004|publisher=Lippincott Williams & Wilkins|isbn=978-0-7817-4316-7]|page=98}}</ref> Warna vagina serta bagian dalam vulva adalah merah jambu kemerahan, dan vagina menghubungkan vulva supervisial dengan leher rahim (serviks) dari [[uterus]] di sebelah dalam. Vagina, yang terletak di belakang (posterior) uretra dan kandung kemih, secara superior mencapai [[perineum]] dan secara posterior menuju leher rahim; leher rahim membelok terhadap vagina, di mana antara keduanya terbentuk sudut sekitar 90 derajat.<ref name="Mulhall">{{cite book | first = John P. | last = Mulhall | editors=John P. Mulhall, Luca Incrocci, Irwin Goldstein, Ray Rosen | title = Cancer and Sexual Health | isbn = 1-60761-915-6| publisher = [8[Springer Publishing|Springer]] | year = 2011 |pages=13–22| accessdate = February 21, 2014 | url = http://books.google.com/?id=GpIadil3YsQC&pg=PA13&dq=#v=onepage&q&f=false}}</ref>
Lapisan internal vagina terdiri dari [[epitel skuamosa berlapis]].<ref [9]name="Wylie">{{cite book|last=Wylie|first=Linda|title=Essential Anatomy and Physiology in Maternity Care|accessdate=19 February 2014|year=2005|publisher=Elsevier Health Sciences|isbn=0-443-10041-1|pages=157–158|url=http://books.google.com/books?id=QgpOvSDxGGYC&pg=PA157}}</ref> Di bawah lapisan ini adalah lapisan [[otot polos]], yang dapat membuat vagina kontraksi selama hubungan seksual serta ketika melahirkan. Di bawah otot adalah lapisan [[jaringan ikat]] yang disebut [[adventitia]].<ref name="Wheater">{{Cite book | editor-last=Young | editor-first=B | title=Wheater's Functional Histology: A Text and Colour Atlas | publisher=[10[Elsevier]] | year=2006 | page=377 | edition=5th | isbn=978-0443068508 }}</ref>