Pemodelan homologi: Perbedaan antara revisi
Konten dihapus Konten ditambahkan
{{subst:kembang}} |
Tidak ada ringkasan suntingan Tag: BP2014 |
||
Baris 1:
[[File:DHRS7B homology model.png|thumb|Pemodelan homologi DHRS7B]]
'''Pemodelan homologi''' digunakan untuk mengetahui struktur [[sekunder]] dari [[sekuen]] [[asam amino]] dengan cara membandingkan dengan sekuen yang telah diketahui strukturnya.<ref name="a">{{en}} Srinivas VR. 2005. ''Bioinformatics A Modern Approach''. New Delhi: Prentice-Hall.</ref> Pemodelan homologi disebut juga dengan pemodelan komparatif yang dapat membentuk secara detil hingga struktur tiga dimensi.<ref name="b">{{en}} Reid RE. 2000. ''Peptide and Protein Drug Analysis''. New York: Marcel Dekker.</ref>
Proses yang dilakukan pertama adalah pensejajaran antara sekuen protein yang belum diketahui dengan semua protein yang ada dalam bank data protein.<ref name="b"/> Setelah dilakukan proses persejajaran dari sekuen asam amino, maka didapatkan beberapa kandidat [[protein]] yang dari dapat dijadikan acuan.<ref name="b"/> Beberapa acuan tersebut dipilih yang memiliki resolusi terbaik yang nantinya akan dijadikan cetakan.<ref name="b"/>
Algoritma pemodelan homologi telah dikembangkan untuk dua hal yaitu:
* Mengkonstruksi struktur yang sangat akurat untuk pengujian protein yang kuat antara sekuen dengan cetakan ( > 60%).<ref name="b"/>
* Mengkonstruksi struktur yang masuk akal untuk pengujian protein yang lemah antara sekuen dengan cetakan ( < 40%).<ref name="b"/>
==Referensi==
{{reflist}}
[[Kategori:Bioinformatika]]
| |||